66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11708 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  339  1e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  72.22 
 
 		 161 aa  249  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  53.09 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  54.43 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  56.16 
 
 		 148 aa  167  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  57.75 
 
 		 278 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  51.85 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  57.75 
 
 		 278 aa  163  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  51.23 
 
 		 161 aa  160  7e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  48.3 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  53.38 
 
 		 297 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  47.33 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  51.8 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  47.22 
 
 		 201 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  37.95 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  37.11 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  36.99 
 
 		 147 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  36.42 
 
 		 164 aa  107  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  48.25 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  57.58 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  37.41 
 
 		 175 aa  103  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  38.12 
 
 		 185 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  38.56 
 
 		 210 aa  94  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  34.38 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  36.81 
 
 		 147 aa  87.4  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  34.31 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  30.86 
 
 		 166 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  33.76 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  31.79 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  50 
 
 		 113 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  48.33 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  45.45 
 
 		 128 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.66 
 
 		 517 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  49.09 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  40 
 
 		 160 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  51.92 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 128 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  43.64 
 
 		 132 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  44.44 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  44.44 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  44.44 
 
 		 202 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  44 
 
 		 211 aa  45.8  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  48.21 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  40 
 
 		 195 aa  44.3  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  44.23 
 
 		 134 aa  44.3  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  46.43 
 
 		 119 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  46.15 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  44.44 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  38.46 
 
 		 206 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  43.14 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  47.06 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  56.52 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  52.17 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  36.36 
 
 		 223 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  56.52 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  46.94 
 
 		 116 aa  42.4  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  36.99 
 
 		 219 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0590  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  33.05 
 
 		 131 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  39.29 
 
 		 217 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4447  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  40.8  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  43.4 
 
 		 202 aa  40.4  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>