72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4811 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  335  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  61.82 
 
 
166 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  65.99 
 
 
151 aa  204  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  63.23 
 
 
167 aa  203  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  56.44 
 
 
167 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  59.33 
 
 
171 aa  190  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  46.48 
 
 
147 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  50.35 
 
 
147 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  38.56 
 
 
164 aa  123  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  40.4 
 
 
175 aa  116  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  40.91 
 
 
170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  36.05 
 
 
157 aa  107  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  37.25 
 
 
161 aa  97.4  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  32.92 
 
 
161 aa  95.1  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  34.18 
 
 
158 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  32.3 
 
 
161 aa  90.5  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  36.77 
 
 
201 aa  87.4  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  34.31 
 
 
163 aa  83.6  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  32.37 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  32.37 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  34.72 
 
 
297 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  32.89 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  35.25 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  28.3 
 
 
161 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  31.65 
 
 
178 aa  74.3  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  33.82 
 
 
185 aa  72  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  35.35 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  35.16 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  33.61 
 
 
118 aa  67.4  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  32.85 
 
 
170 aa  66.2  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  48 
 
 
211 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  44.64 
 
 
202 aa  48.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  44 
 
 
224 aa  47.4  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  43.33 
 
 
192 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  44.64 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  44 
 
 
116 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  46 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2280  hypothetical protein  44 
 
 
226 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  43.14 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  43.14 
 
 
128 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  38.18 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  41.18 
 
 
131 aa  43.9  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0139  protein of unknown function DUF305  41.07 
 
 
237 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  35.71 
 
 
217 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4568  hypothetical protein  46 
 
 
231 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3044  protein of unknown function DUF305  46.94 
 
 
230 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  0.753211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0891  hypothetical protein  42 
 
 
229 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
128 aa  43.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3889  hypothetical protein  44.23 
 
 
227 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.229372 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  42 
 
 
113 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  42.55 
 
 
132 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  45.83 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  41.07 
 
 
208 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 
217 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  40.38 
 
 
119 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2836  hypothetical protein  44 
 
 
215 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5736  hypothetical protein  44.23 
 
 
227 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  44.23 
 
 
120 aa  42  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  44.68 
 
 
131 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  42.31 
 
 
137 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  42 
 
 
198 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  44 
 
 
150 aa  41.6  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  42 
 
 
117 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2368  hypothetical protein  41.18 
 
 
188 aa  41.2  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.838223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  39.22 
 
 
125 aa  41.2  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  44.23 
 
 
237 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  44.23 
 
 
237 aa  41.2  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  40.82 
 
 
134 aa  40.4  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  33.93 
 
 
223 aa  40.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  40 
 
 
205 aa  40.4  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.396776 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>