54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1170 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1170  protein of unknown function DUF305  100 
 
 
148 aa  304  3e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0010  protein of unknown function DUF305  61.81 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0712  hypothetical protein  55.78 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.118157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1589  hypothetical protein  54.42 
 
 
161 aa  169  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000759319  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11708  hypothetical protein  56.16 
 
 
163 aa  167  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3677  hypothetical protein  58.04 
 
 
297 aa  166  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160508 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0695  hypothetical protein  53.74 
 
 
161 aa  166  8e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000975548  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3932  hypothetical protein  56.16 
 
 
278 aa  163  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.609829  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3594  hypothetical protein  56.16 
 
 
278 aa  163  9e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0376172  normal  0.29662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11363  hypothetical protein  54.11 
 
 
161 aa  157  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0359  protein of unknown function DUF305  54.17 
 
 
178 aa  154  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1942  hypothetical protein  53.42 
 
 
170 aa  147  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0287  protein of unknown function DUF305  51.75 
 
 
201 aa  143  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.087537 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6962  protein of unknown function DUF305  44.83 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211177  normal  0.0771819 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4398  hypothetical protein  44.53 
 
 
157 aa  131  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00407  hypothetical protein  57.01 
 
 
137 aa  120  7e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1088  hypothetical protein  46.1 
 
 
185 aa  117  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2305  hypothetical protein  48.57 
 
 
210 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.775317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4663  hypothetical protein  42.86 
 
 
118 aa  98.6  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000351024 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2420  hypothetical protein  36.55 
 
 
147 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.692364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3077  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  93.6  8e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6892  protein of unknown function DUF305  36.55 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6646  protein of unknown function DUF305  36.55 
 
 
170 aa  87.8  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.350625  normal  0.51653 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2051  protein of unknown function DUF305  31.91 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4811  hypothetical protein  35.25 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.405374 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4925  hypothetical protein  32.12 
 
 
147 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3245  hypothetical protein  31.72 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2287  hypothetical protein  30.22 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000356026  hitchhiker  0.00039069 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1322  hypothetical protein  30.22 
 
 
166 aa  67  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.927633  normal  0.338762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3896  hypothetical protein  31.03 
 
 
167 aa  67  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.17 
 
 
517 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  52.17 
 
 
113 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  40.68 
 
 
120 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0121  hypothetical protein  46 
 
 
211 aa  44.7  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.261528  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 
132 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  40.74 
 
 
128 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  30.91 
 
 
223 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  52.17 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  40.74 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2533  hypothetical protein  45.83 
 
 
193 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0056757  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  44.9 
 
 
152 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 
125 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  32.47 
 
 
217 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  40.74 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  46 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  46.94 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0086  hypothetical protein  45.83 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  43.75 
 
 
192 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1047  protein of unknown function DUF305  38.46 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109327 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  39.29 
 
 
217 aa  40.8  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  40.35 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1143  protein of unknown function DUF305  38.89 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>