71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0122 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0122  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  608  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5499  putative outer membrane protein  37.5 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.234024  decreased coverage  0.000160663 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2005  outer membrane protein-like protein  33.33 
 
 		 192 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779308  normal  0.328183 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5576  outer membrane protein-like protein  22.33 
 
 		 179 aa  65.1  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.904013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3182  outer membrane protein-like protein  32.65 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0816  putative outer membrane protein  29.29 
 
 		 173 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3371  outer membrane protein-like protein  41.18 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.435295  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0910  hypothetical protein  44.44 
 
 		 298 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3445  putative outer membrane protein  31.45 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000556959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3558  hypothetical protein  28.8 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0580723  normal  0.864917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1069  outer membrane protein  34.12 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0040  hypothetical protein  28.72 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5552  outer membrane protein-like protein  36.36 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3254  hypothetical protein  24.23 
 
 		 185 aa  58.2  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.111604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3284  putative secreted protein  22.66 
 
 		 179 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3606  putative secreted protein  22.17 
 
 		 179 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5441  hypothetical protein  28.97 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2290  hypothetical protein  26.07 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1728  outer membrane protein  36.36 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403983  hitchhiker  0.000467772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4397  hypothetical protein  29.41 
 
 		 226 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4242  hypothetical protein  21.69 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.962866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4032  outer membrane protein  28.57 
 
 		 208 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2670  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 166 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.541057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0896  hypothetical protein  32.58 
 
 		 318 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1713  outer membrane protein  36.84 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000156481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4919  putative outer membrane protein  43.1 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1165  hypothetical protein  26.73 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0900  hypothetical protein  32.58 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2274  outer membrane protein-like protein  25.18 
 
 		 174 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0408901  hitchhiker  0.00589861 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3241  hypothetical protein  28.16 
 
 		 166 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2520  outer membrane protein-like protein  28.16 
 
 		 166 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.991788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6652  hypothetical protein  25.26 
 
 		 175 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938181 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6054  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2103  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00149204  normal  0.726583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1767  hypothetical protein  26.15 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1639  hypothetical protein  33.9 
 
 		 203 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.204047 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6462  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1367  hypothetical protein  32.61 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0295237  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0602  hypothetical protein  30.53 
 
 		 181 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 186 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4259  hypothetical protein  30.26 
 
 		 214 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.464103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5098  hypothetical protein  25.44 
 
 		 172 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4455  hypothetical protein  24.39 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248989  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2390  hypothetical protein  39.06 
 
 		 182 aa  46.2  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3794  hypothetical protein  40.48 
 
 		 214 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1504  hypothetical protein  21.43 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0334  putative outer membrane protein  30.21 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.510939 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5458  hypothetical protein  27.45 
 
 		 204 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.646751  hitchhiker  0.00225101 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5975  hypothetical protein  27.37 
 
 		 208 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0323  putative outer membrane protein  29.17 
 
 		 169 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0744  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3178  hypothetical protein  31.34 
 
 		 174 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5299  hypothetical protein  22.82 
 
 		 182 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0560052  normal  0.052078 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3148  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.456613  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0511  outer membrane protein-like protein  26.17 
 
 		 172 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7119  hypothetical protein  25.26 
 
 		 177 aa  44.3  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188362  normal  0.116456 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0990  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1970  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.589425  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0851  hypothetical protein  32.22 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.307036  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3987  hypothetical protein  26.8 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4380  hypothetical protein  26.8 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116285  normal  0.971701 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1369  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.75101  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1277  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3833  hypothetical protein  19.79 
 
 		 176 aa  43.9  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.797851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3019  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2252  hypothetical protein  28.81 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.705781  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5348  hypothetical protein  33.87 
 
 		 184 aa  43.9  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.956984 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3515  hypothetical protein  28.3 
 
 		 190 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0129  hypothetical protein  31.75 
 
 		 201 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.359868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36980  hypothetical protein  28.77 
 
 		 190 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0430291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5178  putative outer membrane protein  25.2 
 
 		 183 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.22765 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>