More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4580 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 496 aa  954    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  93.55 
 
 		 494 aa  848    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  93.35 
 
 		 511 aa  843    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.64 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  61.77 
 
 		 478 aa  486  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.81 
 
 		 495 aa  461  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  47.59 
 
 		 492 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  47.12 
 
 		 492 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.42 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.4 
 
 		 492 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.55 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  46.24 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 		 538 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  46 
 
 		 491 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  41.67 
 
 		 474 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 493 aa  312  6.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 		 508 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  39.38 
 
 		 506 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.26 
 
 		 510 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 504 aa  301  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  37.13 
 
 		 541 aa  295  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 517 aa  286  4e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 467 aa  286  5e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  36.29 
 
 		 541 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 		 461 aa  282  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 466 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 465 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 484 aa  264  3e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 		 488 aa  253  6e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 502 aa  250  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 478 aa  240  5e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.43 
 
 		 422 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  35.31 
 
 		 484 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 469 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  31.35 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.46 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  31.5 
 
 		 270 aa  91.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 396 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  33.52 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.83 
 
 		 598 aa  88.2  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  31.33 
 
 		 500 aa  88.2  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  32.79 
 
 		 614 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 425 aa  87.4  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  31.83 
 
 		 458 aa  86.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  33.33 
 
 		 611 aa  86.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 942 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 471 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  31.71 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  31.71 
 
 		 573 aa  84  0.000000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2910  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.07 
 
 		 488 aa  84  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.988017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  31.65 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  28.39 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.47 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 1076 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  33.47 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 705 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 496 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.38 
 
 		 674 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  32.3 
 
 		 555 aa  83.2  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.03 
 
 		 673 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  25.28 
 
 		 516 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.25 
 
 		 734 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  25.27 
 
 		 481 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.66 
 
 		 499 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  26.84 
 
 		 367 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  30.19 
 
 		 489 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 929 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  26.93 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 494 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.98 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 416 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  31.01 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 546 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 		 655 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.51 
 
 		 747 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.09 
 
 		 747 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 677 aa  80.5  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 656 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  33.06 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 480 aa  80.1  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  24.8 
 
 		 1119 aa  80.1  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 963 aa  80.1  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  28.84 
 
 		 522 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  25.51 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  25.51 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  25.51 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>