More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5115 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 478 aa  924    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  85.74 
 
 		 478 aa  750    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  63.15 
 
 		 511 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  62.93 
 
 		 494 aa  504  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.64 
 
 		 496 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.28 
 
 		 495 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  49.33 
 
 		 492 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  48.88 
 
 		 492 aa  430  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.32 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 		 492 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  48.16 
 
 		 495 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  47.95 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 		 538 aa  389  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 		 519 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  46.77 
 
 		 491 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.59 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 		 504 aa  362  1e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  43.79 
 
 		 474 aa  356  3.9999999999999996e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 508 aa  340  4e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.7 
 
 		 510 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  42.83 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 467 aa  332  9e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  39.64 
 
 		 541 aa  323  5e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 493 aa  322  6e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 517 aa  312  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  38.74 
 
 		 541 aa  311  1e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 484 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 		 465 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 466 aa  295  8e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.06 
 
 		 502 aa  286  5e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.78 
 
 		 478 aa  276  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 488 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.53 
 
 		 422 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  34.72 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.82 
 
 		 363 aa  101  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 524 aa  97.8  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 479 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 471 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  31.38 
 
 		 471 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  33.88 
 
 		 397 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 396 aa  93.2  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1101 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 480 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 655 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 725 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 		 494 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 372 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 560 aa  88.2  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.92 
 
 		 1255 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  35.63 
 
 		 887 aa  88.6  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  34.32 
 
 		 614 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 492 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  26.91 
 
 		 517 aa  87.4  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  34.67 
 
 		 489 aa  87  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  25.78 
 
 		 367 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 677 aa  87  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  29.86 
 
 		 270 aa  86.7  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  32.33 
 
 		 673 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.91 
 
 		 393 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.96 
 
 		 695 aa  85.1  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 736 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  31.33 
 
 		 499 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  27.27 
 
 		 1000 aa  85.9  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 		 680 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  31.75 
 
 		 857 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0258  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.32 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3763  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.32 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 516 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 525 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.55 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.86 
 
 		 348 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 416 aa  84  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 953 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.3 
 
 		 752 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 497 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.11 
 
 		 734 aa  83.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  28.94 
 
 		 611 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.93 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0914  signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  27.99 
 
 		 496 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  30.64 
 
 		 597 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 874 aa  83.2  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  31.11 
 
 		 555 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  28.96 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.86 
 
 		 348 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 543 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  34.87 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>