More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0305 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 504 aa  1008    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.34 
 
 		 506 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  49.33 
 
 		 492 aa  429  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  49.44 
 
 		 492 aa  427  1e-118  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 492 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  49.26 
 
 		 495 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 467 aa  411  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  48.2 
 
 		 495 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.02 
 
 		 465 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  48.67 
 
 		 491 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 		 466 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 		 493 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.65 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 508 aa  378  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  43.6 
 
 		 474 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  44.81 
 
 		 506 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 		 484 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 		 510 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.73 
 
 		 538 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.86 
 
 		 478 aa  347  3e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  43.32 
 
 		 541 aa  345  1e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 498 aa  345  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.83 
 
 		 517 aa  341  2e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 		 478 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 		 495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  48.92 
 
 		 478 aa  339  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  42.67 
 
 		 541 aa  335  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 488 aa  319  7e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 502 aa  313  4.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  41.79 
 
 		 494 aa  301  3e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  42.11 
 
 		 511 aa  300  3e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.15 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.88 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.79 
 
 		 422 aa  138  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  30.58 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 		 654 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 759 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 515 aa  103  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 480 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.03 
 
 		 576 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.06 
 
 		 517 aa  100  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 391 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 497 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 622 aa  100  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.22 
 
 		 679 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  24.79 
 
 		 516 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 469 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 543 aa  98.6  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 494 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 1344 aa  97.1  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 1428 aa  96.7  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 510 aa  96.7  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.08 
 
 		 547 aa  96.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 346 aa  96.3  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  34.96 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 581 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  32.42 
 
 		 550 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 497 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 390 aa  95.9  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0914  signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 343 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.51298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 		 494 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  31.62 
 
 		 397 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  27.27 
 
 		 656 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0119  sensor histidine kinase with PAS/PAC  29.34 
 
 		 909 aa  94  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.57 
 
 		 490 aa  94.4  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 479 aa  94  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0586  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 913 aa  94  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415477  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  29.31 
 
 		 614 aa  94  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 689 aa  93.6  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 656 aa  94  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 		 489 aa  93.6  8e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.58 
 
 		 367 aa  93.6  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  32.19 
 
 		 531 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2693  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 		 873 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 655 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  29.23 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.28 
 
 		 655 aa  93.2  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 		 498 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.24 
 
 		 611 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 581 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 491 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 936 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  27 
 
 		 1111 aa  91.7  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.2 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2086  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 		 699 aa  91.7  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1432 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.38 
 
 		 417 aa  90.9  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0035  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.39 
 
 		 921 aa  90.9  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 522 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2632  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 		 906 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  30.67 
 
 		 500 aa  90.1  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.62 
 
 		 393 aa  90.1  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.05 
 
 		 581 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 672 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 		 929 aa  89.4  1e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  33.23 
 
 		 363 aa  89.7  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>