More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0274 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  100 
 
 
541 aa  1095    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  86.63 
 
 
517 aa  863    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  99.08 
 
 
541 aa  1082    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  48.53 
 
 
506 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.53 
 
 
493 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.95 
 
 
510 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.72 
 
 
508 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  49.05 
 
 
474 aa  458  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 
492 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
506 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  44.47 
 
 
492 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.93 
 
 
492 aa  398  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.95 
 
 
495 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  43.95 
 
 
495 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 
504 aa  345  2e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  41.21 
 
 
491 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.11 
 
 
538 aa  334  2e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  40.22 
 
 
478 aa  331  3e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
498 aa  323  4e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
478 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
461 aa  301  2e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 
495 aa  300  6e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
466 aa  294  3e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.28 
 
 
466 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
467 aa  289  7e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
496 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  37.17 
 
 
494 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  36.96 
 
 
511 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
484 aa  266  1e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 
502 aa  258  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
478 aa  257  4e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
488 aa  253  7e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
465 aa  209  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 
422 aa  144  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 
1108 aa  96.3  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
1113 aa  94.4  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.17 
 
 
578 aa  94.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
447 aa  93.6  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
677 aa  92.8  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 
489 aa  92.8  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.47 
 
 
611 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  28 
 
 
975 aa  92  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.8 
 
 
747 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 
516 aa  92.4  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
680 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  30.51 
 
 
611 aa  91.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  28.65 
 
 
484 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.78 
 
 
752 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.4 
 
 
747 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.66 
 
 
747 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 
630 aa  88.2  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
479 aa  88.2  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
525 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
391 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 
703 aa  87.4  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  30.65 
 
 
614 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
526 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
679 aa  87  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
497 aa  86.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  32.49 
 
 
489 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  27.82 
 
 
500 aa  86.7  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
525 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2085  ATP-binding region ATPase domain protein  22.85 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.158999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
576 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
689 aa  84.7  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.69 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  29.24 
 
 
622 aa  84  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  31.71 
 
 
471 aa  83.6  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1102  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.67 
 
 
823 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.813916  normal  0.354207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  28.91 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  28.98 
 
 
673 aa  83.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.33 
 
 
679 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
571 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 
871 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1847  histidine kinase  29.06 
 
 
785 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  24.44 
 
 
654 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.18 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.15 
 
 
490 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  28.01 
 
 
501 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  32.53 
 
 
550 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  29.96 
 
 
487 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  27.05 
 
 
1000 aa  81.6  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 
494 aa  81.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 
503 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
663 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
471 aa  81.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4405  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.61 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198423  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
515 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  27.59 
 
 
621 aa  80.5  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  28.57 
 
 
351 aa  80.5  0.00000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
1519 aa  80.1  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.96 
 
 
734 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.85 
 
 
987 aa  80.1  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>