More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3335 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 346 aa  643    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  30.55 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 492 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  34.23 
 
 		 495 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 465 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 492 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 488 aa  100  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 478 aa  99.8  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.56 
 
 		 495 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 504 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 467 aa  97.1  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 461 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 422 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 506 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  32.57 
 
 		 491 aa  93.6  5e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 465 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 466 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 466 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 519 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 		 484 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  27.92 
 
 		 474 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 493 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 502 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  30.45 
 
 		 506 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 508 aa  87  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  30.23 
 
 		 541 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 510 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 498 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  42.15 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  32.88 
 
 		 478 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4824  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0627622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  32.38 
 
 		 494 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 496 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  32.38 
 
 		 511 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0532  histidine kinase  42.5 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137214  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.31 
 
 		 447 aa  68.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0503  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.502232  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 760 aa  67  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 453 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  31.53 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  30.43 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.61 
 
 		 474 aa  66.2  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 		 679 aa  66.2  0.0000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 736 aa  66.2  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2023  histidine kinase  30.97 
 
 		 473 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.14541  normal  0.618926 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.58 
 
 		 677 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1518  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250734  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1145  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2258  sensor kinase protein  39.25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0095  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 731 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  45.71 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1018  sensor histidine kinase  39.25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1124  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.42 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.963767  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5705  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.64 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  29.73 
 
 		 466 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000238922  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.32 
 
 		 733 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1863  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 846 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855198  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  37.01 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  38.61 
 
 		 472 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1722  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.206152  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2747  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 879 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  36.25 
 
 		 526 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0933  sensor histidine kinase  38.32 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1504  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 835 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  40.74 
 
 		 442 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2613  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 835 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.336024  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2669  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 835 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3088  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 885 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90887  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 885 aa  63.5  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00597808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  30.28 
 
 		 537 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2231  sensory box histidine kinase  29.06 
 
 		 885 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 373 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1221  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 525 aa  63.2  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0121657 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4234  histidine kinase  26.32 
 
 		 828 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.58 
 
 		 518 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4296  CBS sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 		 851 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.277428 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  34.78 
 
 		 419 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 838 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0501  histidine kinase  43.01 
 
 		 945 aa  62.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0931305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2592  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 838 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.625327  hitchhiker  0.00109138 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.9 
 
 		 480 aa  62.8  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 472 aa  62  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 838 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.991509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5174  histidine kinase  35.16 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.544896  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 537 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1132  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 838 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0594373  normal  0.673452 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 538 aa  62  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 517 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>