More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2850 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
519 aa  1023    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  56.93 
 
 
492 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  57.67 
 
 
492 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.66 
 
 
492 aa  498  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  54.03 
 
 
495 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.36 
 
 
506 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  53.33 
 
 
495 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  56.89 
 
 
491 aa  468  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.89 
 
 
504 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 
538 aa  387  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.78 
 
 
478 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.44 
 
 
493 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  49.15 
 
 
478 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.15 
 
 
498 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  45.02 
 
 
506 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.15 
 
 
510 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
508 aa  369  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  43.82 
 
 
474 aa  350  4e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 
495 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  42.17 
 
 
541 aa  338  9.999999999999999e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  41.88 
 
 
541 aa  326  6e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
467 aa  325  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
465 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.41 
 
 
517 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  47.08 
 
 
511 aa  324  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  47.08 
 
 
494 aa  324  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.89 
 
 
496 aa  320  3e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
466 aa  320  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
466 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 
484 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
461 aa  301  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
478 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 
465 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
422 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  31.54 
 
 
367 aa  112  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32.39 
 
 
484 aa  107  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
469 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
480 aa  103  9e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
496 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
479 aa  99.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
518 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  29.76 
 
 
471 aa  94  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
524 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
346 aa  92.8  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
499 aa  92.8  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 
680 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
471 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
679 aa  90.9  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
516 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  30.34 
 
 
343 aa  90.1  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
646 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  30.08 
 
 
936 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
586 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  28.66 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
488 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
652 aa  89.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  28.76 
 
 
614 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  30.92 
 
 
348 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
602 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.63 
 
 
679 aa  88.2  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
695 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  32.88 
 
 
887 aa  87.8  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  32.23 
 
 
354 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
407 aa  87.4  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
1432 aa  87  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.94 
 
 
578 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  25.99 
 
 
501 aa  87  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  30.57 
 
 
419 aa  86.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  27.92 
 
 
498 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1700  PAS sensor, signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
553 aa  86.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.012241  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
487 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  27.57 
 
 
505 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  30.74 
 
 
336 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
493 aa  85.5  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.181871  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
510 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.78 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
689 aa  85.9  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  30.89 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.08 
 
 
1255 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.92 
 
 
490 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  27.69 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
630 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
498 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  27.69 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  27.69 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  29.66 
 
 
611 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 
672 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0852  histidine kinase  29.22 
 
 
528 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.152084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5491  cell cycle control histidine kinase CckA  30.27 
 
 
892 aa  84.7  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606378  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5223  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.18 
 
 
722 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  28.57 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
391 aa  84.7  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3600  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 
766 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.35244  normal  0.024803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  30.57 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>