More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0351 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
508 aa  1020    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  52.72 
 
 
541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  52.4 
 
 
506 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.63 
 
 
510 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  50.52 
 
 
541 aa  435  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.14 
 
 
517 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.66 
 
 
493 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  48.48 
 
 
474 aa  419  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 
504 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
506 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  43.97 
 
 
492 aa  360  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
492 aa  358  9e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
519 aa  351  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  42.44 
 
 
495 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
492 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.77 
 
 
495 aa  341  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  42.6 
 
 
491 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 
467 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
478 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
538 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.96 
 
 
461 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  42.27 
 
 
478 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
495 aa  297  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
465 aa  295  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
498 aa  293  5e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  40.48 
 
 
511 aa  292  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
466 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  40.48 
 
 
494 aa  292  1e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.17 
 
 
484 aa  290  3e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
496 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
466 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.48 
 
 
502 aa  274  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
488 aa  266  7e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 
478 aa  263  6e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
465 aa  223  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  30.07 
 
 
354 aa  103  9e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  31.11 
 
 
501 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  31.64 
 
 
614 aa  97.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
525 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
525 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
469 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.81 
 
 
355 aa  95.9  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  35.29 
 
 
484 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4254  nitrogen regulation protein NR(II)  32.43 
 
 
349 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.388785 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.71 
 
 
457 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03754  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with GlnG  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4117  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4147  nitrogen regulation protein NR(II)  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  28.17 
 
 
348 aa  93.6  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03703  hypothetical protein  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4096  nitrogen regulation protein NR(II)  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5315  nitrogen regulation protein NR(II)  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.962522  normal  0.565649 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4391  nitrogen regulation protein NR(II)  31.98 
 
 
349 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.132536  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4345  nitrogen regulation protein NR(II)  31.98 
 
 
349 aa  93.6  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  29.35 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  27.78 
 
 
336 aa  92.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
496 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
524 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.39 
 
 
611 aa  91.3  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0267  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
631 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.172451  normal  0.0925086 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
391 aa  90.5  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3961  nitrogen regulation protein NR(II)  31.08 
 
 
349 aa  89.4  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  27.64 
 
 
487 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 
526 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4334  nitrogen regulation protein NR(II)  31.53 
 
 
349 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3759  sensor histidine kinase  31.27 
 
 
356 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 
559 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4288  nitrogen regulation protein NR(II)  31.53 
 
 
349 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4217  nitrogen regulation protein NR(II)  31.53 
 
 
349 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732813  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  31.08 
 
 
349 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4238  nitrogen regulation protein NR(II)  31.53 
 
 
349 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.893304  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  36.1 
 
 
483 aa  89  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
598 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0015  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.88 
 
 
350 aa  87.8  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.327507  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4395  nitrogen regulation protein NR(II)  31.08 
 
 
349 aa  87.8  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  30.19 
 
 
499 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
492 aa  87.4  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
867 aa  86.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.126106 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
680 aa  86.7  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  38.62 
 
 
349 aa  86.7  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  28 
 
 
367 aa  86.7  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.25 
 
 
734 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
725 aa  85.9  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
1519 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 
542 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  38.62 
 
 
349 aa  86.7  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  25.45 
 
 
348 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
867 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00129243  normal  0.0294734 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  40.46 
 
 
349 aa  85.9  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
759 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
689 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.26 
 
 
365 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  28.14 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  27.91 
 
 
622 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
480 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  31.39 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2463  two component sensor kinase  28.52 
 
 
872 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.899501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.91 
 
 
578 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>