More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3706 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  94.92 
 
 
492 aa  904    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  82.68 
 
 
491 aa  729    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  79.19 
 
 
495 aa  767    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  86.4 
 
 
506 aa  791    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  77.37 
 
 
495 aa  746    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  100 
 
 
492 aa  974    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  78.25 
 
 
492 aa  750    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.17 
 
 
519 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 
504 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.84 
 
 
478 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.6 
 
 
538 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  45.09 
 
 
541 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  48.1 
 
 
478 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  44.66 
 
 
506 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  49.47 
 
 
494 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 
493 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
498 aa  388  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  49.26 
 
 
511 aa  386  1e-106  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  44.47 
 
 
541 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 
510 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.5 
 
 
496 aa  379  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
508 aa  372  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
517 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  42.4 
 
 
474 aa  360  3e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.54 
 
 
495 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 
467 aa  329  8e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.33 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
488 aa  312  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 
484 aa  309  9e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.51 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.13 
 
 
465 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.92 
 
 
478 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
465 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.3 
 
 
422 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 
346 aa  105  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
679 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
677 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
496 aa  98.6  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  26.83 
 
 
367 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.8 
 
 
611 aa  93.2  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
407 aa  93.6  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32.4 
 
 
484 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  29.43 
 
 
468 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  29.43 
 
 
468 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.87 
 
 
490 aa  92  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
469 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
472 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  28.9 
 
 
328 aa  91.3  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
479 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
543 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.9 
 
 
457 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
929 aa  89.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
499 aa  88.2  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
447 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
592 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
524 aa  86.7  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 
630 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  27.96 
 
 
592 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 
492 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
1432 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
631 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
497 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0067  histidine kinase  24.94 
 
 
651 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
802 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.17 
 
 
622 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
495 aa  85.1  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.95 
 
 
623 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
652 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 
1113 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
464 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  30.85 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  29.32 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 
502 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
646 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  29.03 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
598 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
474 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  32.52 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
987 aa  83.6  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 
407 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.47 
 
 
547 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  33.46 
 
 
573 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.31 
 
 
532 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 
680 aa  83.2  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
556 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.11 
 
 
679 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  25.95 
 
 
654 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  29.08 
 
 
857 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  30.25 
 
 
471 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  41.44 
 
 
483 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  28.69 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  28.28 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  24.81 
 
 
1000 aa  81.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>