More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0067 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0067  histidine kinase  100 
 
 		 651 aa  1326    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 466 aa  108  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 641 aa  105  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  30.52 
 
 		 484 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 378 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  29.92 
 
 		 1682 aa  100  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 		 639 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  29.04 
 
 		 1347 aa  99.8  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 645 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 518 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2223  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 457 aa  98.6  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450879  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.21 
 
 		 496 aa  97.8  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  33.93 
 
 		 367 aa  97.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  29.61 
 
 		 458 aa  97.1  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0399  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 519 aa  97.4  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.99 
 
 		 484 aa  96.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  27.9 
 
 		 463 aa  97.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 639 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  29.18 
 
 		 465 aa  95.9  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  29.18 
 
 		 458 aa  95.9  2e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  29.18 
 
 		 458 aa  96.3  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5152  ATPase domain-containing protein  29.13 
 
 		 1682 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 		 662 aa  96.3  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.73 
 
 		 461 aa  95.9  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 		 390 aa  96.3  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 640 aa  95.9  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4635  histidine kinase  31.23 
 
 		 440 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  0.951565 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1450  histidine kinase  33.74 
 
 		 446 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  30.96 
 
 		 369 aa  94.7  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 422 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  24.94 
 
 		 1282 aa  94.7  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  29.46 
 
 		 465 aa  94.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 467 aa  94  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  29.46 
 
 		 465 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 469 aa  94  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  28.76 
 
 		 458 aa  94  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  25.99 
 
 		 1230 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  29.46 
 
 		 465 aa  93.6  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 581 aa  93.2  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  29.29 
 
 		 465 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  25.39 
 
 		 471 aa  92.8  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3892  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 512 aa  92.8  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.234407 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  24.83 
 
 		 581 aa  92.8  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  28.76 
 
 		 458 aa  93.2  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 464 aa  92.4  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  29.05 
 
 		 465 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  28.76 
 
 		 458 aa  92  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  23.73 
 
 		 656 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  26.06 
 
 		 468 aa  91.7  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.52 
 
 		 1215 aa  91.7  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  26.21 
 
 		 492 aa  91.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  24.7 
 
 		 458 aa  91.3  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.42 
 
 		 656 aa  91.3  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  28.57 
 
 		 1234 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 372 aa  91.3  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 496 aa  91.3  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0373  sensor histidine kinase  26.09 
 
 		 500 aa  91.3  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.09 
 
 		 458 aa  90.9  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  28.34 
 
 		 501 aa  90.9  6e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  28.33 
 
 		 458 aa  90.9  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  27.24 
 
 		 1255 aa  91.3  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  23.71 
 
 		 458 aa  90.9  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2042  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 379 aa  90.9  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.419009  hitchhiker  0.00181161 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  32.34 
 
 		 367 aa  90.9  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 491 aa  90.9  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.04 
 
 		 463 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  27.53 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  24.01 
 
 		 463 aa  90.1  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 367 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1650  histidine kinase  28.05 
 
 		 612 aa  90.1  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  26.69 
 
 		 1133 aa  90.1  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 534 aa  90.5  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.311499 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  26.23 
 
 		 470 aa  89.4  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  23.78 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 532 aa  89.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  29.28 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6110  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 513 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.09 
 
 		 458 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 		 1119 aa  89  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  23.78 
 
 		 458 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 654 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  23.78 
 
 		 458 aa  88.2  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 		 581 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 476 aa  88.6  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  29.02 
 
 		 581 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 680 aa  88.2  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0962  sensor histidine kinase  24.84 
 
 		 655 aa  88.2  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0631  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 501 aa  87.8  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22133  normal  0.283314 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  23.79 
 
 		 595 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  23.47 
 
 		 462 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  26.35 
 
 		 484 aa  88.2  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.09 
 
 		 458 aa  87.8  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1343  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 510 aa  87.8  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 		 594 aa  87.8  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  29.79 
 
 		 450 aa  87.8  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 		 488 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>