More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3077 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 492 aa  974    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  77.37 
 
 		 495 aa  756    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  84.21 
 
 		 506 aa  778    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  76.77 
 
 		 495 aa  745    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  82.03 
 
 		 491 aa  727    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  94.92 
 
 		 492 aa  904    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.24 
 
 		 492 aa  744    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.26 
 
 		 519 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.26 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 504 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  45.51 
 
 		 541 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.31 
 
 		 538 aa  396  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  48.52 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.09 
 
 		 510 aa  392  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.42 
 
 		 493 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  44.99 
 
 		 506 aa  393  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.8 
 
 		 498 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  44.89 
 
 		 541 aa  387  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  48.18 
 
 		 494 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  47.97 
 
 		 511 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.56 
 
 		 517 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.06 
 
 		 496 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  42.83 
 
 		 474 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.97 
 
 		 495 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 467 aa  319  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.47 
 
 		 502 aa  312  1e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 466 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.52 
 
 		 488 aa  308  2.0000000000000002e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.01 
 
 		 466 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 		 484 aa  307  3e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 		 461 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 478 aa  276  6e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 465 aa  222  9e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.41 
 
 		 422 aa  156  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 679 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 496 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 346 aa  100  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  27.64 
 
 		 367 aa  100  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 407 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 543 aa  96.7  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 469 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.31 
 
 		 457 aa  93.6  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  30.65 
 
 		 348 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32.8 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  29.84 
 
 		 336 aa  92.4  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  29.77 
 
 		 468 aa  92  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  29.77 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 1432 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 630 aa  90.9  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 472 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.18 
 
 		 611 aa  90.5  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 		 499 aa  90.1  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 524 aa  89.7  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 929 aa  88.2  3e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 652 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 490 aa  87.4  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  32.77 
 
 		 483 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 390 aa  87  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  29.88 
 
 		 354 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30 
 
 		 490 aa  87.4  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  27.92 
 
 		 328 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 		 1113 aa  87  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 447 aa  87  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 455 aa  87  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  26.08 
 
 		 654 aa  86.7  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 622 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.48 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 680 aa  85.9  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  29.89 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 592 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 464 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 503 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.534636  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.99 
 
 		 1108 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 502 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 885 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 695 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0644  GAF sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 		 754 aa  84.3  0.000000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.95 
 
 		 623 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  28.1 
 
 		 592 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.06 
 
 		 1162 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.31 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  34.78 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.29 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 646 aa  83.2  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 476 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  27.65 
 
 		 481 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2428  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.72 
 
 		 656 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00399652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>