More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0639 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  79 
 
 		 492 aa  745    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 492 aa  978    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  73.58 
 
 		 491 aa  671    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  90.91 
 
 		 495 aa  882    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  82.68 
 
 		 506 aa  752    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  90.71 
 
 		 495 aa  875    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  78.25 
 
 		 492 aa  751    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.66 
 
 		 519 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.72 
 
 		 504 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  45.79 
 
 		 541 aa  395  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  46.28 
 
 		 506 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 		 510 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.26 
 
 		 478 aa  391  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  44.59 
 
 		 541 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  47.39 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.32 
 
 		 517 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 		 493 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 498 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  47.07 
 
 		 494 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.64 
 
 		 496 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.6 
 
 		 538 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  46.85 
 
 		 511 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  43.04 
 
 		 474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 508 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 		 495 aa  354  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 467 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.39 
 
 		 502 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 		 488 aa  314  1.9999999999999998e-84  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 484 aa  312  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 466 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 		 466 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 		 461 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 		 465 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 478 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 465 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  27.18 
 
 		 468 aa  107  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  27.18 
 
 		 468 aa  106  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  28.11 
 
 		 367 aa  100  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.46 
 
 		 407 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 677 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 679 aa  97.8  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 346 aa  97.4  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 499 aa  96.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 		 630 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 479 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 		 496 aa  94  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 		 492 aa  92.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 474 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7273  histidine kinase  29.69 
 
 		 472 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.567939  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 1432 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  29.8 
 
 		 621 aa  90.5  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 646 aa  90.5  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 455 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 652 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 		 611 aa  89.4  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  35.34 
 
 		 623 aa  88.6  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 478 aa  88.6  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  28.66 
 
 		 328 aa  89  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  29.41 
 
 		 348 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  30.28 
 
 		 354 aa  88.2  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 469 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  27.37 
 
 		 654 aa  87.8  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  29.02 
 
 		 336 aa  87.8  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  31.22 
 
 		 397 aa  87.8  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2559  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 460 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.974152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 680 aa  87.8  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  34.06 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3883  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.73 
 
 		 457 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 497 aa  87.4  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.24 
 
 		 703 aa  87.4  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 714 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.84 
 
 		 490 aa  87  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0913  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1057  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 496 aa  86.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  34.03 
 
 		 483 aa  86.7  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.75 
 
 		 752 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0586  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 913 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.415477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  28.16 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  30.54 
 
 		 502 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2517  Signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.22 
 
 		 576 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4172  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.583754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.57 
 
 		 942 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.63 
 
 		 345 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.26 
 
 		 1255 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 		 622 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.86 
 
 		 1108 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.51 
 
 		 679 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>