More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0461 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
488 aa  956    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  42.04 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 
504 aa  317  2e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.02 
 
 
492 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
492 aa  315  8e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.6 
 
 
495 aa  312  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  42.38 
 
 
495 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.59 
 
 
506 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
519 aa  296  7e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  40.35 
 
 
491 aa  293  5e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
502 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 
484 aa  281  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
461 aa  280  5e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  36.58 
 
 
506 aa  280  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 
467 aa  279  9e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
510 aa  273  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
465 aa  272  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  35.7 
 
 
474 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 
466 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
493 aa  269  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
508 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
466 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
495 aa  254  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
478 aa  253  7e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  40.17 
 
 
511 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  39.61 
 
 
494 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  33.26 
 
 
541 aa  251  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
496 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
538 aa  250  5e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  39.64 
 
 
478 aa  249  6e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
478 aa  249  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
541 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
517 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
498 aa  233  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
465 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
422 aa  135  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  30.58 
 
 
487 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  25.42 
 
 
516 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
515 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
497 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32 
 
 
484 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.93 
 
 
541 aa  107  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.82 
 
 
499 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.06 
 
 
695 aa  103  6e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  30.58 
 
 
517 aa  103  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
464 aa  103  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1275 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 
330 aa  101  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 
495 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.93 
 
 
598 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
491 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 
494 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.65 
 
 
759 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.75 
 
 
578 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  32.79 
 
 
501 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  32.93 
 
 
614 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
498 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
576 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 
525 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
671 aa  98.2  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  31.42 
 
 
498 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 
586 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 
491 aa  97.8  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
677 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
526 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 
542 aa  97.1  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 
525 aa  96.7  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  33.07 
 
 
887 aa  96.7  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  33.48 
 
 
555 aa  96.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
346 aa  96.7  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 
703 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
662 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.27 
 
 
457 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  35.38 
 
 
573 aa  96.3  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  32.11 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
502 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
929 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 
1168 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  29.08 
 
 
542 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 
721 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
586 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  29.96 
 
 
528 aa  94.4  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.1 
 
 
516 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  33.07 
 
 
548 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1700  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 
767 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  29.96 
 
 
528 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 
496 aa  94.4  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  30.77 
 
 
661 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
931 aa  94  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.98 
 
 
804 aa  93.6  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.2 
 
 
530 aa  94  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  32.2 
 
 
530 aa  94  6e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  27.88 
 
 
468 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
516 aa  93.6  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
494 aa  93.6  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.22 
 
 
490 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0892  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
738 aa  92.4  1e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  24.85 
 
 
502 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2610  histidine kinase  33.33 
 
 
552 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
532 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>