More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4099 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  99.6 
 
 		 494 aa  946    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 511 aa  986    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  93.35 
 
 		 496 aa  832    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  63.5 
 
 		 478 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.15 
 
 		 478 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.39 
 
 		 495 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  48.37 
 
 		 492 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  47.03 
 
 		 492 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.87 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  46.55 
 
 		 495 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 		 492 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  46.34 
 
 		 495 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.01 
 
 		 498 aa  361  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 538 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  45.93 
 
 		 491 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  41.03 
 
 		 474 aa  326  8.000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.08 
 
 		 519 aa  323  6e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 493 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 		 504 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.48 
 
 		 508 aa  309  5.9999999999999995e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  39.91 
 
 		 506 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.79 
 
 		 510 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.3 
 
 		 466 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 		 465 aa  297  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.62 
 
 		 467 aa  293  4e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.08 
 
 		 466 aa  292  9e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  36.49 
 
 		 541 aa  290  4e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 461 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 517 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  35.59 
 
 		 541 aa  278  1e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 484 aa  267  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.26 
 
 		 488 aa  256  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.7 
 
 		 502 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39 
 
 		 478 aa  242  9e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 		 465 aa  207  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 422 aa  137  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  34.26 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  33.07 
 
 		 270 aa  94  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 469 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  34.67 
 
 		 471 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  32.53 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.13 
 
 		 491 aa  91.3  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.52 
 
 		 491 aa  90.5  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 494 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 425 aa  88.6  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.83 
 
 		 598 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  26.13 
 
 		 481 aa  88.2  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  31.5 
 
 		 614 aa  87.4  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3302  histidine kinase  32.11 
 
 		 573 aa  87  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 455 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  27.44 
 
 		 499 aa  86.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3606  histidine kinase  32.11 
 
 		 573 aa  85.5  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 655 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  28.57 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3335  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 942 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5287  histidine kinase  30.06 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.531754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.25 
 
 		 734 aa  84.7  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  32.9 
 
 		 674 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  30.73 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  32.33 
 
 		 555 aa  84  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.9 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  33.9 
 
 		 530 aa  84  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  22.88 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0550  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.14 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.671139  normal  0.0432359 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 713 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0360535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  32.01 
 
 		 445 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  32.52 
 
 		 611 aa  83.2  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  29.58 
 
 		 673 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 484 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 480 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0375  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.803434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 372 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0126  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 705 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 407 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 656 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 484 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.27 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4983  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0185741 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6322  histidine kinase  31.75 
 
 		 276 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 628 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 484 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  34.27 
 
 		 363 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0576  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 507 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  25.95 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  25.4 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1076 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  30.7 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  30.7 
 
 		 528 aa  81.3  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  27.74 
 
 		 656 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>