More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6068 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  85.74 
 
 
478 aa  759    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  100 
 
 
478 aa  922    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  63.5 
 
 
511 aa  512  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  63.28 
 
 
494 aa  510  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.77 
 
 
496 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.96 
 
 
495 aa  473  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  48.55 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  48.11 
 
 
492 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 
506 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.39 
 
 
492 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  47.72 
 
 
495 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  47.86 
 
 
495 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.15 
 
 
519 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.47 
 
 
538 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  46.89 
 
 
491 aa  371  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.92 
 
 
504 aa  366  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 
498 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  43.79 
 
 
474 aa  351  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
467 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.01 
 
 
510 aa  335  9e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  40.09 
 
 
541 aa  333  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  42.05 
 
 
506 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.43 
 
 
493 aa  330  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.27 
 
 
508 aa  325  7e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
517 aa  323  4e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
461 aa  322  7e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  39.19 
 
 
541 aa  321  9.999999999999999e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
484 aa  319  6e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.97 
 
 
466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.8 
 
 
465 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
466 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 
502 aa  280  3e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.16 
 
 
478 aa  272  8.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
488 aa  254  2.0000000000000002e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.97 
 
 
422 aa  140  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.23 
 
 
363 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
489 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  34.19 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
425 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  33.21 
 
 
887 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5521  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
524 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.90101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
492 aa  90.1  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 
447 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 
516 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
496 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
479 aa  87.8  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1776  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.82 
 
 
1255 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
372 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  32.62 
 
 
614 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  39.6 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.37 
 
 
538 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
494 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
457 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 
680 aa  84  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.83 
 
 
491 aa  84  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4428  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
622 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  30.49 
 
 
487 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  28.4 
 
 
1000 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
703 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3232  histidine kinase  28.16 
 
 
270 aa  82.8  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  31.2 
 
 
597 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 
871 aa  82.4  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  28.57 
 
 
470 aa  83.2  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
576 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
752 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  27.38 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 
494 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
729 aa  82.4  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  36.48 
 
 
483 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
744 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  30.54 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 
491 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  43.41 
 
 
822 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
457 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  25.48 
 
 
654 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
530 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.64 
 
 
804 aa  81.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  27.69 
 
 
982 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
592 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 
541 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
463 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  29.39 
 
 
673 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
480 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  26.96 
 
 
458 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
560 aa  80.5  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.65 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0852  histidine kinase  30.83 
 
 
528 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.152084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  34.67 
 
 
530 aa  80.5  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  31.9 
 
 
611 aa  80.1  0.00000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2460  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
797 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  29.17 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  29.52 
 
 
528 aa  79.7  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2239  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
756 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.292158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>