More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2330 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
538 aa  1065    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.37 
 
 
498 aa  503  1e-141  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  44.65 
 
 
492 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
492 aa  386  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 
506 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.76 
 
 
478 aa  364  2e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  41.93 
 
 
495 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.12 
 
 
519 aa  361  2e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.7 
 
 
492 aa  356  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 
504 aa  352  1e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  41.14 
 
 
495 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  44.47 
 
 
478 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  42.71 
 
 
491 aa  342  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  43.94 
 
 
511 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  43.74 
 
 
494 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.04 
 
 
496 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  38.16 
 
 
541 aa  323  4e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  38.31 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  38.96 
 
 
506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.86 
 
 
493 aa  318  1e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.83 
 
 
510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  38.59 
 
 
541 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.45 
 
 
517 aa  313  4.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
495 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 
467 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 
465 aa  292  8e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
466 aa  289  9e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
484 aa  286  7e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
466 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
461 aa  281  1e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
478 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
502 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
488 aa  238  2e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
422 aa  139  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
494 aa  95.9  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
469 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
543 aa  92  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 
505 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  31.94 
 
 
484 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  28 
 
 
887 aa  90.5  6e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
492 aa  90.5  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.17 
 
 
541 aa  89  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  24 
 
 
516 aa  88.2  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5659  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
680 aa  88.2  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  24.59 
 
 
1000 aa  87.4  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 
479 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
407 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
680 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.53 
 
 
679 aa  86.3  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  25.21 
 
 
499 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  29.49 
 
 
468 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2440  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
375 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.467167  normal  0.627522 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.52 
 
 
490 aa  84.7  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  25 
 
 
487 aa  84  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  28.69 
 
 
975 aa  84  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
399 aa  83.6  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  31.56 
 
 
397 aa  82.8  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
630 aa  83.2  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.21 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1573  histidine kinase  30.58 
 
 
767 aa  82.4  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0740881  normal  0.0763149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
392 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.99 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
733 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1586  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
494 aa  82  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.864341 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
695 aa  81.3  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.77 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2502  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0167  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  27.57 
 
 
655 aa  80.5  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
386 aa  80.1  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2521  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
571 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0595753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
664 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
447 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  28.22 
 
 
857 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
368 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
537 aa  79.3  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.35 
 
 
576 aa  79  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5234  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
946 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
760 aa  79  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
953 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 
575 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  25.38 
 
 
654 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
654 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0486  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
837 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000590544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2605  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.96 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2811  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
829 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2435  histidine kinase  28.74 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 
497 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3472  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
520 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6198  putative two component sensor histidine kinase  26.45 
 
 
458 aa  77.8  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
587 aa  78.2  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 
508 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
495 aa  77.8  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>