More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0173 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 495 aa  968    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 522 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03966  two-component system sensor protein  41.19 
 
 		 480 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.4 
 
 		 487 aa  282  9e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4906  putative two-component system sensor protein  40.24 
 
 		 495 aa  282  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.419562 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6323  histidine kinase  40.87 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395524 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6735  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231093  normal  0.929987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 490 aa  252  9.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  41.72 
 
 		 489 aa  250  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6500  histidine kinase  41.71 
 
 		 423 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2058  histidine kinase  36.36 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 581 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 491 aa  126  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 487 aa  125  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  35.62 
 
 		 530 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.36 
 
 		 679 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 367 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  37.36 
 
 		 506 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.93 
 
 		 491 aa  118  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 498 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 680 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  33.95 
 
 		 529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2438  histidine kinase  36.44 
 
 		 382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.401185 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 		 531 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 419 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 829 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  29.61 
 
 		 499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  29.06 
 
 		 517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  32.35 
 
 		 531 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  36.2 
 
 		 530 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  33.61 
 
 		 550 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  32.38 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 525 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 469 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  32.93 
 
 		 461 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 689 aa  110  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  35.45 
 
 		 530 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 461 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  31.6 
 
 		 621 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1634  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 462 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0264776  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.69 
 
 		 490 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.02 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  31.65 
 
 		 530 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  33.18 
 
 		 611 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  31.2 
 
 		 611 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 524 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  36.13 
 
 		 630 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 543 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  30.8 
 
 		 234 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1707  histidine kinase  32.27 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3250  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 488 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.521419  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.51 
 
 		 393 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  35.4 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 396 aa  108  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  31.8 
 
 		 829 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3099  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 591 aa  107  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.564011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  32.91 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 832 aa  107  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.23 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 1519 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 461 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 		 372 aa  106  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  32.49 
 
 		 458 aa  106  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 642 aa  106  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 526 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.5 
 
 		 546 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  32.49 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18640  sensory histidine protein kinase,two-component  33.96 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  32.49 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 619 aa  106  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.47 
 
 		 457 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  32.75 
 
 		 465 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2383  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.13 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0311727  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  32.49 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72390  putative two-component sensor  37.04 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  32.91 
 
 		 458 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2626  histidine kinase  35.96 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  32.49 
 
 		 458 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 535 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1329  histidine kinase  35.96 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  32.74 
 
 		 537 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  30.65 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5309  sensor histidine kinase  32.82 
 
 		 1744 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0910571 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  26.5 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 548 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2530  histidine kinase  35.53 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.266857  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  29.05 
 
 		 603 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  33.07 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0352523 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 673 aa  105  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>