More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6060 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 522 aa  1048    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6735  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.41 
 
 		 509 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231093  normal  0.929987 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6323  histidine kinase  51.41 
 
 		 496 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6500  histidine kinase  52.83 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 495 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03966  two-component system sensor protein  32.63 
 
 		 480 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.72 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 		 487 aa  243  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4906  putative two-component system sensor protein  34.54 
 
 		 495 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.419562 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2058  histidine kinase  36.33 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  37.16 
 
 		 489 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  36.29 
 
 		 611 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 492 aa  123  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.45 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.05 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  31.97 
 
 		 829 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  33.89 
 
 		 450 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3855  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 829 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  34.17 
 
 		 367 aa  118  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 378 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 494 aa  117  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.98 
 
 		 491 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 372 aa  117  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  30.13 
 
 		 614 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3996  histidine kinase  37.95 
 
 		 459 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  32.91 
 
 		 369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.18 
 
 		 604 aa  115  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  34.18 
 
 		 604 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 367 aa  114  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 364 aa  114  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  37.38 
 
 		 515 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 515 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 505 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 680 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  33.76 
 
 		 458 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 832 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 367 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  34.03 
 
 		 465 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.48 
 
 		 519 aa  111  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.27 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.77 
 
 		 367 aa  111  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  33.47 
 
 		 830 aa  110  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  32.91 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02892  putative sensory box sensor histidine kinase in two-component regulatory system  34.71 
 
 		 380 aa  110  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  32.91 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 595 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  34.03 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 396 aa  109  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  34.03 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 525 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  32.91 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  30.06 
 
 		 600 aa  109  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  30.9 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  32.49 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 525 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  36.32 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  33.33 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 515 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  32.49 
 
 		 465 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.7 
 
 		 611 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  31.86 
 
 		 234 aa  108  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  32.49 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  34.82 
 
 		 857 aa  108  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  34.86 
 
 		 621 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  31.89 
 
 		 501 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  27.9 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 		 725 aa  107  7e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.35 
 
 		 547 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 517 aa  106  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 527 aa  107  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 465 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  33.61 
 
 		 465 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.72 
 
 		 1162 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 		 581 aa  106  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 594 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  31.28 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  31.91 
 
 		 531 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.25 
 
 		 734 aa  105  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.93 
 
 		 611 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1365  histidine kinase  29.02 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  26.35 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 368 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.91 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  35.34 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 661 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1803  histidine kinase  32.6 
 
 		 360 aa  105  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 514 aa  104  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>