More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03966 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03966  two-component system sensor protein  100 
 
 		 480 aa  963    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 495 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 522 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 		 487 aa  257  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.15 
 
 		 490 aa  256  8e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4906  putative two-component system sensor protein  36.14 
 
 		 495 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.419562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  36.67 
 
 		 489 aa  221  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6323  histidine kinase  34.46 
 
 		 496 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395524 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6735  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 509 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231093  normal  0.929987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2058  histidine kinase  34.64 
 
 		 474 aa  210  5e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6500  histidine kinase  36.83 
 
 		 423 aa  209  7e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  30.35 
 
 		 450 aa  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.17 
 
 		 598 aa  110  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 378 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  26.25 
 
 		 522 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  28.57 
 
 		 517 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.8 
 
 		 547 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 494 aa  104  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 581 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 491 aa  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.36 
 
 		 491 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  29.31 
 
 		 829 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  30.49 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.18 
 
 		 383 aa  101  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  30.03 
 
 		 499 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 673 aa  100  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.93 
 
 		 519 aa  100  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 586 aa  99.8  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.48 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 575 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  33.48 
 
 		 530 aa  99  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  30.48 
 
 		 487 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 829 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  31.28 
 
 		 611 aa  98.2  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3275  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 631 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  27.08 
 
 		 598 aa  97.1  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  33.03 
 
 		 611 aa  97.1  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.65 
 
 		 367 aa  96.7  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 594 aa  96.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2148  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 729 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  31.88 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 582 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 929 aa  95.5  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 595 aa  94.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  32.06 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3168  histidine kinase  30.32 
 
 		 369 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  31.03 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 		 492 aa  94.4  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 510 aa  94.4  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  31.05 
 
 		 234 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  31.19 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  30.67 
 
 		 458 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  30.73 
 
 		 465 aa  94  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  31.03 
 
 		 458 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  30.67 
 
 		 458 aa  94  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0832  PAS  32.44 
 
 		 984 aa  94  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00253594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 367 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  30.67 
 
 		 458 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 364 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  30.73 
 
 		 465 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  31.03 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  30.73 
 
 		 465 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.6 
 
 		 458 aa  93.2  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3568  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 874 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.489697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  29.07 
 
 		 475 aa  93.2  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  30.22 
 
 		 458 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 652 aa  93.2  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 473 aa  93.2  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 		 491 aa  92.8  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  30.73 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 602 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5442  two-component sensor CbrA  32.09 
 
 		 983 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3166  histidine kinase  32.45 
 
 		 517 aa  92.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.143728 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62530  two-component sensor CbrA  32.09 
 
 		 983 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.7 
 
 		 679 aa  92.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3670  sporulation kinase A  26.78 
 
 		 510 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1538  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 394 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.461461  normal  0.397408 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 1519 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.52 
 
 		 457 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.08 
 
 		 345 aa  91.3  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3674  sporulation kinase A  26.78 
 
 		 510 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.123371  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 518 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 543 aa  91.3  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0752  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 352 aa  90.5  6e-17  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.980748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  31.05 
 
 		 419 aa  90.5  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  26.92 
 
 		 604 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.92 
 
 		 604 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1846  histidine kinase  30.68 
 
 		 501 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.390703 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 		 390 aa  90.5  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2378  histidine kinase  34.18 
 
 		 418 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0564708  normal  0.0270592 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.46 
 
 		 538 aa  90.1  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3702  sporulation kinase A  26.78 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 516 aa  89.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.67 
 
 		 747 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3749  sporulation kinase A  26.36 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1567  sporulation kinase A  26.36 
 
 		 510 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.800828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>