More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2997 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2997  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 490 aa  980    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.45317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4906  putative two-component system sensor protein  49.19 
 
 		 495 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.419562 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.53 
 
 		 487 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.17561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  47.45 
 
 		 489 aa  326  6e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03966  two-component system sensor protein  38.15 
 
 		 480 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6060  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.973623  normal  0.0594236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 495 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6323  histidine kinase  41.72 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.395524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6500  histidine kinase  41.49 
 
 		 423 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.125418  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6735  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.49 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.231093  normal  0.929987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2058  histidine kinase  33.79 
 
 		 474 aa  211  3e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.287802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  37.93 
 
 		 450 aa  133  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 515 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 564 aa  127  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  36.73 
 
 		 611 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 378 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 618 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  36.36 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.47 
 
 		 598 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.93 
 
 		 604 aa  117  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 575 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 		 492 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  29.88 
 
 		 391 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1182  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.44 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000499107  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  30.43 
 
 		 655 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1365  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.25 
 
 		 567 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.63 
 
 		 679 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2101  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 483 aa  114  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 447 aa  114  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 372 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  33.63 
 
 		 465 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.13 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.22 
 
 		 674 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 662 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  30.26 
 
 		 614 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  30.41 
 
 		 487 aa  110  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 395 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 458 aa  110  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 680 aa  110  6e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1339  sensor histidine kinase, C-terminal region; sporulation kinase  26.34 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.01 
 
 		 547 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 394 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1340  sporulation kinase  26.34 
 
 		 420 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  32.74 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 		 671 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  31.06 
 
 		 499 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  32.74 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1381  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.45 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.413033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1550  sensor histidine kinase  26.34 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000335626 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  32.61 
 
 		 458 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  32.61 
 
 		 458 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 559 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 689 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  29.04 
 
 		 517 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 595 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 		 339 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 491 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1583  sensor histidine kinase, putative  26.13 
 
 		 423 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  32.62 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  32.62 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  32.62 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  32.62 
 
 		 465 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0916  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.1 
 
 		 599 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000947728  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 546 aa  107  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00093231 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  28.57 
 
 		 415 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  33.19 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.89 
 
 		 367 aa  107  5e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  29.86 
 
 		 621 aa  107  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1619  sensor histidine kinase  25.11 
 
 		 423 aa  107  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  32.62 
 
 		 465 aa  107  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.63 
 
 		 661 aa  107  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 499 aa  107  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  28.51 
 
 		 590 aa  107  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  28.63 
 
 		 595 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 509 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.26 
 
 		 611 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  26.9 
 
 		 522 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 494 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 491 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  28.17 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  31.98 
 
 		 617 aa  105  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 582 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 412 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  28.06 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3736  histidine kinase  33.47 
 
 		 675 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  28.73 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  32.11 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  28.17 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 645 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.68 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>