More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0215 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0215  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
531 aa  1088    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.69088 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0661  signal transduction histidine kinase  38.48 
 
 
537 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1806  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
619 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0722  signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 
552 aa  281  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00200947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0824  sensor protein PilS  36.58 
 
 
531 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1537  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0723  type IV pilus sensor protein PilS  36.2 
 
 
530 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.43 
 
 
549 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0815467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5186  two-component sensor PilS  36.59 
 
 
530 aa  273  6e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0875  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 
548 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3289  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.72 
 
 
531 aa  269  7e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.290961  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60250  two-component sensor PilS  36.87 
 
 
530 aa  269  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000371089 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  31.32 
 
 
528 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  31.13 
 
 
528 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4839  sensor protein PilS  36.4 
 
 
529 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.82522  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2617  histidine kinase  37.78 
 
 
531 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.000901254  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0966  sensor protein PilS  37.43 
 
 
530 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.253807  normal  0.772393 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3165  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
592 aa  239  6.999999999999999e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.374256  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2116  two-component system, sensor protein  34.02 
 
 
536 aa  238  3e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
555 aa  238  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.435386  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04880  two-component system sensor protein  31.13 
 
 
537 aa  233  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.457628  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2554  sensor protein PilS  32.84 
 
 
528 aa  225  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.041487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2545  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.668362  normal  0.0765765 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2270  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
548 aa  193  7e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0676  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
576 aa  193  7e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.268239  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0959  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
566 aa  176  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0379  histidine kinase  29.55 
 
 
694 aa  174  2.9999999999999996e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0254109 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1504  histidine kinase  30.25 
 
 
587 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1499  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.22 
 
 
571 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
572 aa  164  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3217  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
642 aa  162  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.478958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2643  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
679 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  28.57 
 
 
550 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.35 
 
 
547 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
566 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
678 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2939  histidine kinase  31.02 
 
 
566 aa  154  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.875107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.63 
 
 
679 aa  154  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2944  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
705 aa  152  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549384  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.84 
 
 
539 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3344  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
584 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.134517 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2808  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.08 
 
 
682 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561745  normal  0.251067 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.69 
 
 
530 aa  146  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  31.69 
 
 
530 aa  146  9e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1634  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.95 
 
 
538 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1111  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
571 aa  144  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28025  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.79 
 
 
546 aa  144  6e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.36 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
559 aa  140  7e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
525 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
526 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
525 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2679  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.31 
 
 
544 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2848  histidine kinase  34.17 
 
 
481 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.25 
 
 
621 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.66 
 
 
679 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1487  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.79 
 
 
491 aa  120  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.470629  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 
549 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.9 
 
 
578 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 
903 aa  117  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1389  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.531963  normal  0.0257718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.53 
 
 
611 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
1519 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  31.74 
 
 
487 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  28.96 
 
 
608 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  28.96 
 
 
608 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.96 
 
 
608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  28.96 
 
 
608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  28.96 
 
 
608 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
680 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  34.1 
 
 
248 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.37 
 
 
747 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.81 
 
 
929 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 
661 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
611 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  29.74 
 
 
610 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 
832 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
492 aa  109  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.917004  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0184  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.62 
 
 
555 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.37523  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 
755 aa  108  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  32.64 
 
 
486 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.69 
 
 
608 aa  108  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
495 aa  108  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.875361  hitchhiker  0.00423579 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0969  sensory histidine kinase AtoS  26.8 
 
 
622 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000351141  normal  0.40359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
540 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  32 
 
 
420 aa  107  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0903  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
898 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345455  normal  0.909605 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
412 aa  107  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.13 
 
 
720 aa  107  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
339 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0285  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.87 
 
 
867 aa  107  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00119398  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  25.21 
 
 
415 aa  106  1e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
872 aa  106  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3556  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 
523 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0292  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
393 aa  105  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.183452  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0966  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
615 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.595194  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  32.72 
 
 
248 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
604 aa  105  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>