More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5427 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  74.36 
 
 		 498 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 508 aa  1025    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.2 
 
 		 498 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.66 
 
 		 498 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  68.86 
 
 		 497 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.21 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.21 
 
 		 504 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  67.86 
 
 		 504 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  66.73 
 
 		 504 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.08 
 
 		 504 aa  586  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.6 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  60.98 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.96 
 
 		 498 aa  532  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  59.96 
 
 		 498 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  60.89 
 
 		 498 aa  517  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.17 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  53.33 
 
 		 488 aa  489  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.8 
 
 		 489 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 490 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  34.99 
 
 		 506 aa  306  6e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 488 aa  254  3e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  33.79 
 
 		 496 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  35.59 
 
 		 494 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 493 aa  203  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 493 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 485 aa  170  7e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 480 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 480 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  29.8 
 
 		 457 aa  156  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  29.22 
 
 		 457 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  30.57 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  31.23 
 
 		 455 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.48 
 
 		 458 aa  143  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 487 aa  143  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 458 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  33.73 
 
 		 352 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 458 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.72 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.48 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  28.3 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.85 
 
 		 496 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 597 aa  136  9e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37 
 
 		 1162 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  34.69 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 597 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 367 aa  131  3e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 640 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 504 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 594 aa  130  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 473 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 604 aa  129  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3041  two-component sensor histidine kinase, phosphate regulation  28.38 
 
 		 350 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.575064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  33.23 
 
 		 343 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  34.1 
 
 		 389 aa  127  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 365 aa  126  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 		 889 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 423 aa  125  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00841086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 		 581 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 571 aa  125  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 582 aa  125  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  27.47 
 
 		 488 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.11 
 
 		 537 aa  124  5e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 645 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 592 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5512  histidine kinase  29.63 
 
 		 359 aa  124  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  26.18 
 
 		 465 aa  123  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 587 aa  123  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1587  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0618595  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0045  histidine kinase  31.13 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  31.13 
 
 		 347 aa  122  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1186  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1623  sensor histidine kinase  28.4 
 
 		 603 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  32.38 
 
 		 885 aa  121  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.1 
 
 		 587 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 689 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  32.1 
 
 		 587 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  32.1 
 
 		 587 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.1 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.1 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  28.91 
 
 		 689 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.1 
 
 		 587 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.1 
 
 		 587 aa  120  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 608 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 		 422 aa  120  7e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.57 
 
 		 463 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>