More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3277 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  963    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  98.96 
 
 		 480 aa  954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.86 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.46 
 
 		 493 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 493 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 496 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  32 
 
 		 506 aa  225  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 498 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 490 aa  195  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 497 aa  195  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  31.3 
 
 		 501 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  32.1 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 498 aa  182  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 487 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  33.18 
 
 		 498 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  33.15 
 
 		 457 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  31.57 
 
 		 457 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  29.72 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 501 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 508 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 488 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 498 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 489 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  28.29 
 
 		 494 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  28.9 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 		 473 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  31.48 
 
 		 474 aa  106  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 680 aa  104  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  27.78 
 
 		 468 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.75 
 
 		 781 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0265  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 697 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3284  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 856 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0250894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0554  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 675 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.71067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 459 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 493 aa  100  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 459 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1352 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1355  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.872823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4376  histidine kinase  34.23 
 
 		 593 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.904194  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1420  sensory box histidine kinase/response regulator  35.96 
 
 		 1199 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.293149  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3356  histidine kinase  30.63 
 
 		 633 aa  99.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2314  histidine kinase  27.54 
 
 		 487 aa  99.4  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.421015  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.26 
 
 		 587 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  28.87 
 
 		 1196 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  27.27 
 
 		 496 aa  98.6  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  30.2 
 
 		 810 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.26 
 
 		 587 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 463 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4096  histidine kinase  33.94 
 
 		 604 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005496 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 424 aa  97.8  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 1203 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3065  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 1128 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 585 aa  97.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 710 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 1154 aa  97.4  6e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  28.82 
 
 		 587 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.82 
 
 		 587 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  28.82 
 
 		 587 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.82 
 
 		 587 aa  97.1  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  28.82 
 
 		 587 aa  97.1  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  28.16 
 
 		 352 aa  96.7  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  24.2 
 
 		 455 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  24.2 
 
 		 455 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  28.82 
 
 		 587 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.82 
 
 		 587 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 1010 aa  95.9  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.36 
 
 		 606 aa  95.5  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  28.82 
 
 		 587 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2918  Cache sensor hybrid histidine kinase  22.94 
 
 		 779 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.618331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0873  histidine kinase  29.72 
 
 		 396 aa  94.7  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00136581  normal  0.0338555 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4180  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1126 aa  95.1  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0796198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 		 459 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0977  histidine kinase  29.96 
 
 		 551 aa  95.1  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0254133 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.07 
 
 		 1765 aa  94.4  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 468 aa  94.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 		 837 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  27.34 
 
 		 1346 aa  94.4  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 		 1182 aa  94.4  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2974  histidine kinase  27 
 
 		 298 aa  94.4  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.355012 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  27.48 
 
 		 1392 aa  94  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.22 
 
 		 589 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  27.2 
 
 		 1074 aa  94  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 484 aa  93.6  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 885 aa  93.6  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 870 aa  93.6  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0588  ATP-binding region ATPase domain protein  25.93 
 
 		 1068 aa  93.2  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3632  histidine kinase  27.44 
 
 		 421 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.230628 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 		 1240 aa  92.8  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 768 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4122  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.85 
 
 		 1853 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  27.36 
 
 		 486 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 815 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>