More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001206 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  91.01 
 
 		 457 aa  838    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  100 
 
 		 457 aa  947    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 493 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 488 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  31.34 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 504 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  30.64 
 
 		 504 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 480 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  29.42 
 
 		 498 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.42 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 		 493 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 501 aa  172  9e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 485 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 508 aa  170  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  26.34 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 498 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 504 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 487 aa  160  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  28.54 
 
 		 496 aa  160  5e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 489 aa  158  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  29.81 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  25.75 
 
 		 494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  26.54 
 
 		 363 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 501 aa  90.1  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 562 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000280494  hitchhiker  0.000000000000157693 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 487 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 469 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  26.32 
 
 		 486 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 469 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 480 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  25 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 545 aa  84  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  24.25 
 
 		 391 aa  83.6  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  23.14 
 
 		 368 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 480 aa  82.4  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  25.38 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  25.1 
 
 		 496 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  23.78 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 468 aa  79  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0783  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  22.67 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  24.88 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  25.49 
 
 		 520 aa  77  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  25.91 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 518 aa  76.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07900  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 471 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 1385 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  25.41 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0898  histidine kinase  26.15 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.468744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  25 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  26.34 
 
 		 347 aa  75.5  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0557  histidine kinase  27 
 
 		 559 aa  75.5  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  23.81 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 		 473 aa  75.1  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 608 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  21.43 
 
 		 467 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 471 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 587 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  25.08 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  22.51 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  25.1 
 
 		 447 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  25.07 
 
 		 464 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8878  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 460 aa  73.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 		 520 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.86 
 
 		 510 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0153981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.62 
 
 		 590 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 509 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4990  sensor histidine kinase  24.32 
 
 		 368 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 902 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1174  histidine kinase  27.27 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  25.67 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.56 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>