More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5784 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  99.2 
 
 		 498 aa  981    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  77.1 
 
 		 498 aa  671    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  90.78 
 
 		 501 aa  852    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.96 
 
 		 504 aa  820    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  75.46 
 
 		 498 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  89.68 
 
 		 504 aa  867    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  88.89 
 
 		 504 aa  837    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 497 aa  989    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  89.68 
 
 		 504 aa  867    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  68.86 
 
 		 508 aa  636    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  66.33 
 
 		 501 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.42 
 
 		 504 aa  560  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.81 
 
 		 498 aa  535  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  61.81 
 
 		 498 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  62.37 
 
 		 498 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.4 
 
 		 487 aa  523  1e-147  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.41 
 
 		 488 aa  517  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.94 
 
 		 489 aa  476  1e-133  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.9 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  34.41 
 
 		 506 aa  292  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 		 488 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  32.73 
 
 		 496 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 493 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  32.85 
 
 		 494 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 493 aa  188  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 480 aa  188  2e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 480 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 		 485 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  29.34 
 
 		 457 aa  172  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  29.95 
 
 		 457 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 487 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.19 
 
 		 496 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  35.86 
 
 		 486 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 493 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 468 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  27.2 
 
 		 463 aa  136  9e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  27.2 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  27.2 
 
 		 463 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 581 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 413 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.35 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.81 
 
 		 462 aa  134  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.53 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  27.83 
 
 		 467 aa  134  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 		 608 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 1153 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 604 aa  133  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  35.63 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  34.09 
 
 		 347 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  26.91 
 
 		 463 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  29.15 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 597 aa  131  3e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.2 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3137  histidine kinase  29.91 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 364 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  32.45 
 
 		 540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 365 aa  130  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0186  histidine kinase  33.86 
 
 		 810 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 571 aa  130  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  28.57 
 
 		 356 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 458 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 		 619 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 640 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  25.73 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  25.41 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 470 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 396 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 499 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 639 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 504 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  127  7e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  34.31 
 
 		 555 aa  126  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 597 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  25.08 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.4 
 
 		 463 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  34.03 
 
 		 885 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 597 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0169  histidine kinase  28.08 
 
 		 465 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 594 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 639 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.15 
 
 		 1162 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 889 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 599 aa  124  5e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  26.97 
 
 		 456 aa  123  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 888 aa  123  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.67 
 
 		 465 aa  123  9e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 945 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 		 463 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 639 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>