More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1008 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 488 aa  973    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  35.5 
 
 		 496 aa  293  4e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  40.08 
 
 		 498 aa  285  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 498 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.8 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 		 499 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 		 504 aa  278  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.68 
 
 		 504 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 498 aa  277  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 488 aa  277  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  39.23 
 
 		 498 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  38.58 
 
 		 501 aa  272  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  33.47 
 
 		 506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.6 
 
 		 508 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.39 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 498 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  38.68 
 
 		 504 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 490 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 498 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 504 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 		 489 aa  226  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  33.69 
 
 		 494 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 480 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 		 480 aa  157  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 485 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  26.6 
 
 		 457 aa  141  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  27.84 
 
 		 457 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 355 aa  139  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 407 aa  131  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  25.62 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  25.62 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.52 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1986  sensor protein VanS  28.87 
 
 		 291 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.871173  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0702  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 344 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.305923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 639 aa  128  3e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0708  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 344 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.651662  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0722  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.24 
 
 		 344 aa  128  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0142895 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  35.19 
 
 		 486 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  25.21 
 
 		 463 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  31.7 
 
 		 463 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  25.21 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  25.31 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  25.21 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1957  sensor histidine kinase, putative  26.76 
 
 		 355 aa  125  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.409258  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 487 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.09 
 
 		 593 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 640 aa  124  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1716  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0201227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1690  sensor histidine kinase  27.09 
 
 		 375 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  33.72 
 
 		 496 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4195  histidine kinase  31.58 
 
 		 592 aa  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445902  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3472  sensor protein VanS  27 
 
 		 337 aa  123  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.290028  hitchhiker  0.000000136839 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  24.95 
 
 		 462 aa  124  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.25 
 
 		 457 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 597 aa  123  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0036  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 340 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  38.26 
 
 		 594 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.04 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 639 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1913  sensory box histidine kinase  27.46 
 
 		 288 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0149315 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.46 
 
 		 467 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 500 aa  121  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  26.1 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 639 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 614 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2914  histidine kinase  25.86 
 
 		 520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.705646  normal  0.368156 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  25.15 
 
 		 463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.21 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  28.57 
 
 		 501 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  26.74 
 
 		 368 aa  120  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 458 aa  120  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  33.22 
 
 		 423 aa  120  7.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 600 aa  120  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.69 
 
 		 463 aa  119  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 462 aa  119  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  24.74 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 468 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1772  Signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 345 aa  119  9.999999999999999e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.01 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  31.13 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  30.56 
 
 		 449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 458 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  28 
 
 		 502 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 613 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  33.44 
 
 		 363 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.47 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 463 aa  118  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 458 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1870  sensor protein VanS  26.83 
 
 		 291 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  26.51 
 
 		 458 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  28.57 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  36 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>