More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04993 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  100 
 
 		 457 aa  947    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  91.01 
 
 		 457 aa  838    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 		 493 aa  190  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  31.01 
 
 		 501 aa  186  6e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 480 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.57 
 
 		 480 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 504 aa  176  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 		 498 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  28.97 
 
 		 498 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  30.47 
 
 		 504 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 504 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 493 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 508 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 501 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  26.43 
 
 		 506 aa  167  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.72 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 485 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 504 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 498 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 		 487 aa  156  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  29.38 
 
 		 498 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  29.54 
 
 		 496 aa  150  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 488 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  26.51 
 
 		 494 aa  131  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  27.55 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 		 379 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0594  sensor histidine kinase/response regulator  24.3 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 		 440 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000280494  hitchhiker  0.000000000000157693 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  24.29 
 
 		 468 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0988  histidine kinase  26.32 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.638134  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14320  periplasmic sensory histidine protein kinase  24.27 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.951937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4691  histidine kinase  22.75 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31490  signal transduction histidine kinase  26.06 
 
 		 545 aa  78.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.168456  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 487 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.35 
 
 		 375 aa  79  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3962  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.93 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  23.98 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  23.98 
 
 		 616 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  24.24 
 
 		 496 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2355  sensor histidine kinase  22.13 
 
 		 482 aa  77.4  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000138078  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  25.75 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  24.79 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0917  histidine kinase  25 
 
 		 447 aa  77  0.0000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0435182  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2131  ATPase domain-containing protein  25.4 
 
 		 483 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0675603  decreased coverage  0.00126356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2121  histidine kinase  28.5 
 
 		 420 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3752  ATP-binding region ATPase domain protein  28.5 
 
 		 825 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.88 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  27.86 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 889 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  23.96 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5009  sensor histidine kinase  21.18 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22580  signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1155  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.56 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.978252  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01983  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with BaeR  25.56 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1578  histidine kinase  25.56 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582013  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2220  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.56 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  24.48 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1563  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.56 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.32078  normal  0.70665 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01975  hypothetical protein  25.56 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 614 aa  73.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2278  histidine kinase  24.76 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.208594  normal  0.0146611 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 		 589 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 581 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  21.79 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 509 aa  73.2  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  22.14 
 
 		 582 aa  73.2  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3018  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.56 
 
 		 467 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0391914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  22.73 
 
 		 518 aa  72.8  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  24.83 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 		 837 aa  72.8  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  24.29 
 
 		 469 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 453 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2688  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  28.17 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.660879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 		 587 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2370  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  25.56 
 
 		 467 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2052  histidine kinase  24.64 
 
 		 520 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.390802  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>