More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0288 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 493 aa  1001    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.461614 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0484  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.78 
 
 		 485 aa  535  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.09 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  47.25 
 
 		 480 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0141667 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.17 
 
 		 480 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.211619 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0650  sensor histidine kinase  32.87 
 
 		 496 aa  252  1e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3704  hypothetical protein  32.42 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.178612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 499 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1507  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 488 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 504 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.453108 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1560  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6269  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 504 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.131733  normal  0.543189 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5549  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 498 aa  204  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.961003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6758  histidine kinase  32.21 
 
 		 504 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.459146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5784  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.321286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0306  histidine kinase  32.28 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.290923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0544  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 487 aa  199  9e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3072  histidine kinase  30.97 
 
 		 501 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0034743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2987  histidine kinase  32.93 
 
 		 498 aa  195  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181014  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6810  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 501 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.979574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 498 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 508 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0814  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.400537 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001206  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  32.52 
 
 		 457 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04993  histidine kinase  32.05 
 
 		 457 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1008  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 488 aa  176  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1174  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 504 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782466  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1375  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 490 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2489  histidine kinase  30.44 
 
 		 494 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190195  normal  0.237117 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.121358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 458 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  32.95 
 
 		 496 aa  124  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.03 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  28.03 
 
 		 467 aa  120  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 		 571 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  26 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2194  histidine kinase  23.56 
 
 		 464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 640 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 467 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1915  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.94 
 
 		 463 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000195525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 487 aa  114  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2001  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 		 1121 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 639 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  28.78 
 
 		 449 aa  113  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  25.32 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 589 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  25.32 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1762  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 1146 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.468259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  25.39 
 
 		 508 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 460 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 310 aa  111  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 1182 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 470 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  25 
 
 		 458 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0577  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 476 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.763592  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 504 aa  111  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 466 aa  110  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  25 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  25 
 
 		 458 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 775 aa  110  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  24.44 
 
 		 779 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 456 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  24.92 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  23.78 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  23.78 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  27.55 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2624  histidine kinase  27.41 
 
 		 466 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000627853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 784 aa  108  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 641 aa  108  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  24.68 
 
 		 458 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 947 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  27.59 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 639 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  24.88 
 
 		 1014 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  27.59 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  24.37 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 585 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 489 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 376 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  26.32 
 
 		 466 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  33.48 
 
 		 646 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3365  sensor histidine kinase  27.21 
 
 		 357 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  hitchhiker  0.0000000000000135665 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2521  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 597 aa  107  7e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 592 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.08 
 
 		 902 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  23.17 
 
 		 469 aa  106  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3786  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 606 aa  106  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  24.61 
 
 		 458 aa  106  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  31.06 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>