More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0334 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 467 aa  924    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.86 
 
 		 466 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  64.64 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.07 
 
 		 465 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  64.57 
 
 		 461 aa  568  1e-161  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  62.75 
 
 		 484 aa  552  1e-156  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62 
 
 		 478 aa  523  1e-147  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.09 
 
 		 504 aa  399  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.05 
 
 		 508 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 		 506 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 		 495 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  40.76 
 
 		 492 aa  319  7e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.96 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 		 493 aa  311  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  40.35 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  42.21 
 
 		 506 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  39.62 
 
 		 474 aa  309  5.9999999999999995e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  40.58 
 
 		 492 aa  309  6.999999999999999e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.48 
 
 		 510 aa  309  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  44.81 
 
 		 478 aa  307  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 		 538 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  40.35 
 
 		 495 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 		 478 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 519 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 498 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  40.85 
 
 		 491 aa  292  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  38.62 
 
 		 494 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  36.42 
 
 		 541 aa  276  6e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  38.62 
 
 		 511 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 		 502 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.28 
 
 		 488 aa  269  1e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.3 
 
 		 496 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  35.56 
 
 		 541 aa  265  1e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 517 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 465 aa  220  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.42 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 494 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  26.67 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0039  histidine kinase  29.73 
 
 		 655 aa  107  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  28.89 
 
 		 499 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  30.43 
 
 		 887 aa  101  4e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.564838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  28.78 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 		 576 aa  99  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 480 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  30.26 
 
 		 975 aa  97.4  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  28.27 
 
 		 367 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2473  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 493 aa  96.3  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 391 aa  96.7  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 733 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0258  two component sensor histidine kinase  28.75 
 
 		 556 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 525 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 		 703 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4008  histidine kinase  35.91 
 
 		 376 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4124  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.21839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.29 
 
 		 346 aa  94.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  28.05 
 
 		 468 aa  94.4  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.33 
 
 		 745 aa  94  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 525 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  28.43 
 
 		 468 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  32.02 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.35 
 
 		 541 aa  92.4  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  32.48 
 
 		 484 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 497 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 484 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  24.5 
 
 		 516 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  28.52 
 
 		 613 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 929 aa  92.4  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6014  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 474 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0058306 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  33.91 
 
 		 745 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 464 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 958 aa  91.3  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1318  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 680 aa  91.3  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  33.77 
 
 		 764 aa  91.3  4e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4150  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.98 
 
 		 376 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 497 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  25.86 
 
 		 1000 aa  90.5  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  28.29 
 
 		 1258 aa  90.5  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0633  ATP-binding region ATPase domain protein  28.7 
 
 		 340 aa  90.5  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 496 aa  90.5  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1113 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0078  histidine kinase  28.33 
 
 		 475 aa  90.1  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 725 aa  90.1  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 		 503 aa  90.1  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 453 aa  89.7  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  28.46 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  30.38 
 
 		 423 aa  89.7  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  30.08 
 
 		 611 aa  89.7  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0804  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 663 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296509  normal  0.022202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 602 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.525886  normal  0.309242 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  26.56 
 
 		 986 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 504 aa  89.4  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4055  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 586 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.174789 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  30.38 
 
 		 705 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 731 aa  89.4  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1299  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 618 aa  88.6  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000225639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>