More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5066 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
495 aa  952    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  59.02 
 
 
494 aa  463  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  59.02 
 
 
511 aa  462  1e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  59.96 
 
 
478 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.12 
 
 
496 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.28 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  45.9 
 
 
492 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.69 
 
 
492 aa  362  8e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
492 aa  362  1e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46.17 
 
 
506 aa  359  8e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  44.75 
 
 
495 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  44.91 
 
 
495 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.04 
 
 
504 aa  346  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.16 
 
 
498 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
467 aa  341  2e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 
519 aa  333  4e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  45.56 
 
 
491 aa  333  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  40.74 
 
 
474 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
538 aa  326  6e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.06 
 
 
493 aa  316  6e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
484 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.23 
 
 
508 aa  312  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.39 
 
 
461 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.42 
 
 
466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
510 aa  306  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  40.37 
 
 
506 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.87 
 
 
465 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  39.75 
 
 
541 aa  303  4.0000000000000003e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.99 
 
 
466 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.25 
 
 
517 aa  300  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  38.77 
 
 
541 aa  292  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.29 
 
 
478 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 
488 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 
502 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 
465 aa  193  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
422 aa  126  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  36.22 
 
 
484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
469 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
479 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4402  histidine kinase  33.89 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.913757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4379  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
471 aa  94  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1181  hypothetical protein  33.02 
 
 
528 aa  92  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1175  hypothetical protein  33.02 
 
 
528 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.73 
 
 
576 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1091  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
757 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.414611  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5988  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
516 aa  90.9  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
492 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 
425 aa  88.2  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
655 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
733 aa  88.2  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3476  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
437 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  28.63 
 
 
614 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  30.11 
 
 
472 aa  87.8  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.05 
 
 
530 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  33.05 
 
 
530 aa  87.4  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
733 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.95 
 
 
598 aa  87  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
494 aa  87  8e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1882  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.66 
 
 
652 aa  86.7  9e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0696304  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  29.58 
 
 
431 aa  86.7  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
655 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1816  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
756 aa  86.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0544205 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  30.21 
 
 
500 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
496 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000141182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2069  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
653 aa  84.7  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 
929 aa  84.7  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1443  sensor histidine kinase/response regulator  26.74 
 
 
654 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.676986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0709  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
489 aa  84.7  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.737809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
372 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 
756 aa  84.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4124  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
485 aa  84.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
546 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.63 
 
 
490 aa  84.3  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  25.96 
 
 
483 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  29.64 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  29.39 
 
 
458 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
457 aa  83.6  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0771  sensor histidine kinase  31.4 
 
 
391 aa  82.8  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.08 
 
 
1162 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.6 
 
 
674 aa  82  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4807  two-component sensor kinase CbrA  27.31 
 
 
982 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0111257 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
480 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  26.01 
 
 
367 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  27.6 
 
 
465 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2844  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
550 aa  82  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
368 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
592 aa  81.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.14941  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2410  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  30.04 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.75 
 
 
578 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  29.41 
 
 
499 aa  81.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  30.2 
 
 
458 aa  81.3  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0520  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.11 
 
 
751 aa  81.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2746  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 
1096 aa  80.9  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.455726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>