More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7323 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7323  putative sensor histidine kinase  100 
 
 
491 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  73.58 
 
 
492 aa  695    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251898  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3077  Signal transduction histidine kinase  82.03 
 
 
492 aa  763    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0686  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  74.55 
 
 
495 aa  709    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.723155  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0820  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  80.22 
 
 
506 aa  736    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0067  ATP-binding region, ATPase-like  73.54 
 
 
495 aa  697    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.491711  hitchhiker  0.00453262 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3706  histidine kinase  82.68 
 
 
492 aa  765    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.421002  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.39 
 
 
519 aa  468  9.999999999999999e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.916439  normal  0.413843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0305  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.61 
 
 
504 aa  405  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0099  histidine kinase  44.42 
 
 
506 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3530  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
498 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0792957  normal  0.828938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5115  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.52 
 
 
478 aa  383  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0716188  hitchhiker  0.00491502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.09 
 
 
510 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.386696 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0085  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
493 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.11 
 
 
538 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6068  histidine kinase  47.72 
 
 
478 aa  370  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201334  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4099  ATPase domain-containing protein  46.78 
 
 
511 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.165494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4467  histidine kinase  47 
 
 
494 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.106277  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.58 
 
 
508 aa  365  1e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4580  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.85 
 
 
496 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.730418 
 
 
-
 
NC_004310  BR0274  sensor histidine kinase  41.86 
 
 
541 aa  358  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0453  two component sensor kinase  41.7 
 
 
474 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156809  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.02 
 
 
495 aa  350  3e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0948498 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.67 
 
 
517 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0289  sensor histidine kinase  41.23 
 
 
541 aa  347  2e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.712529  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0334  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 
467 aa  323  6e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0995263  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.61 
 
 
484 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0461  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.3 
 
 
488 aa  300  3e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1056  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
466 aa  300  5e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.511775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0316  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
461 aa  297  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 
466 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.401537  normal  0.0193829 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
502 aa  297  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.9 
 
 
465 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.801183 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0871  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
478 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2136  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
465 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1112  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.39 
 
 
422 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.46212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3335  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
346 aa  103  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  31.95 
 
 
328 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1188  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
679 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.91419 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3457  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.7 
 
 
345 aa  97.1  7e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0871385  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3303  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
496 aa  96.7  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.739503  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
677 aa  96.3  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.465536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 
652 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2534  cyclic nucleotide-binding protein  26.42 
 
 
367 aa  95.9  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.809153  normal  0.0324751 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0321  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.3 
 
 
345 aa  94.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2807  histidine kinase  30.07 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.85206 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
472 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.607361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2584  ATPase domain-containing protein  30.07 
 
 
468 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3426  nitrogen regulation protein  30.22 
 
 
348 aa  92  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.204004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.42 
 
 
348 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0854  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.74 
 
 
490 aa  89.7  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.48 
 
 
495 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 
510 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0262  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.42 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.507954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0317  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
407 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3598  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
479 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4246  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
469 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2320  nitrogen regulation protein NR(II)  29.08 
 
 
354 aa  89  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  29.84 
 
 
348 aa  89  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.42 
 
 
348 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0247  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
407 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.982907  normal  0.433647 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  29.84 
 
 
336 aa  88.6  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0267  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.42 
 
 
348 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0283  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.39 
 
 
346 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000323653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4395  histidine kinase  30.91 
 
 
484 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.448772  normal  0.535318 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
1432 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 
630 aa  87  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
576 aa  86.7  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.413012  normal  0.0352192 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0259  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.06 
 
 
348 aa  86.7  9e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.627159  hitchhiker  0.00000191471 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1376  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
499 aa  86.3  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.20257  normal  0.926367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2329  histidine kinase  34.36 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3961  nitrogen regulation protein NR(II)  31.08 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4882  nitrogen regulation protein NR(II)  28.86 
 
 
349 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.191848  hitchhiker  0.00011549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2759  two component sensor histidine kinase  29.76 
 
 
764 aa  85.9  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000152723  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
598 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235161  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.67 
 
 
346 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0363  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.64 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.63729 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0184  sensor protein PilS, putative  32.64 
 
 
530 aa  84.7  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0258  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.7 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000414466 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3763  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.7 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2511  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
543 aa  84.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.54 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4650  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.98 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.617913 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4471  nitrogen regulation protein  28.06 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4190  nitrogen regulation protein NR(II)  27.02 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.497456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0028  nitrogen regulation protein NR(II)  27.02 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.533996  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.47 
 
 
492 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0026  nitrogen regulation protein NR(II)  27.02 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.968773  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4158  nitrogen regulation protein NR(II)  30.63 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.128409  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  30.63 
 
 
349 aa  84  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2364  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
646 aa  84.3  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.765238  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  30.63 
 
 
349 aa  84.3  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31 
 
 
457 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3471  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
464 aa  84  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.551338  normal  0.47179 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0372  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.09 
 
 
348 aa  84  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.37 
 
 
929 aa  83.6  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  30.37 
 
 
577 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
653 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3371  histidine kinase  30.63 
 
 
887 aa  82.8  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.564838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>