More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1957 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1957  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 443 aa  877    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0083917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3684  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.84 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.714122  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0167  histidine kinase  42.79 
 
 		 429 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02837  two-component system sensor protein required for AvrXa21activity H2 (raxH2)  36.68 
 
 		 456 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1841  two-component system, sensor protein  35.5 
 
 		 482 aa  259  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.775188  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 		 482 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.480782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3304  sensor histidine kinase  35.89 
 
 		 466 aa  252  7e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.232472 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0442368  normal  0.692011 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3354  ribose 5-phosphate isomerase  31.77 
 
 		 456 aa  234  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000158163  normal  0.115638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1131  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 442 aa  232  8.000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 475 aa  232  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.587392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0281  sensor histidine kinase  32.05 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.012454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 454 aa  230  4e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0526543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4141  histidine kinase  33.11 
 
 		 454 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02298  sensor histidine kinase  34.07 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4648  sensor histidine kinase  33.86 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0243  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 440 aa  222  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.182435 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3853  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3818  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 454 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00854299  decreased coverage  0.0034747 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2504  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 		 443 aa  216  7e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3247  sensor histidine kinase  32.51 
 
 		 469 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000098482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3909  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 454 aa  216  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000571443  normal  0.530607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4026  ATPase domain-containing protein  33.03 
 
 		 454 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2841  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 		 445 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1263  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.7 
 
 		 474 aa  209  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000081586  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1389  sensor protein PhoQ  31.93 
 
 		 470 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.812387  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3381  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 466 aa  203  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 484 aa  202  9e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000110077  normal  0.128468 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2936  histidine kinase  28.49 
 
 		 517 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00120898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 459 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3708  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 448 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642299  hitchhiker  0.00152873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0631  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 459 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0181536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1680  sensor protein PhoQ  31.56 
 
 		 448 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1831  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0398387  normal  0.55748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2127  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 448 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0937  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 461 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.159129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4113  ATPase domain-containing protein  35.28 
 
 		 448 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779025  normal  0.819443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4239  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 450 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2349  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000892956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4481  histidine kinase  34.95 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.410421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1434  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 449 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3453  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 464 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5126  two component sensor kinase  31.42 
 
 		 456 aa  168  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2615  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0121943 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003785  signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0077957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 448 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.796582  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1849  histidine kinase  32.45 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00571096  hitchhiker  0.00108599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 		 465 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.374305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3068  putative two-component sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 458 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5129  putative two-component sensor histidine kinase  31.94 
 
 		 448 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.60361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 451 aa  166  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02659  hypothetical protein  28.79 
 
 		 449 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1723  ATPase domain-containing protein  32.45 
 
 		 449 aa  163  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124766 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2256  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 449 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2805  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0689547  hitchhiker  0.00033988 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1745  histidine kinase  30.14 
 
 		 450 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000105534  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1245  sensor histidine kinase  31.55 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271676  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1579  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 449 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.15351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  30.47 
 
 		 487 aa  159  8e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0604  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 436 aa  159  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0605  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.972928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1945  sensor protein PhoQ  32.23 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 448 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2474  sensor protein PhoQ  31.19 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1996  sensor protein PhoQ  30.89 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.687103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1249  sensor protein PhoQ  31.19 
 
 		 486 aa  157  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2673  histidine kinase  32.79 
 
 		 436 aa  157  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2616  histidine kinase  31.49 
 
 		 474 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1188  Signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1590  sensor protein PhoQ  30.89 
 
 		 486 aa  157  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000452252 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  27.62 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2518  histidine kinase  30.89 
 
 		 486 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.208145  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1307  sensor protein PhoQ  30.89 
 
 		 486 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1292  sensor protein PhoQ  30.89 
 
 		 486 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01127  sensory histidine kinase in two-compoent regulatory system with PhoP  30.89 
 
 		 486 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01135  hypothetical protein  30.89 
 
 		 486 aa  156  9e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4594  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0435  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 481 aa  154  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.711544 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0123  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 442 aa  153  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  30.49 
 
 		 487 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  30.49 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  30.49 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  30.49 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  30.49 
 
 		 487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1541  sensor protein PhoQ  32.68 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  32.09 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1865  sensor protein PhoQ  26.25 
 
 		 484 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1684  histidine kinase  34.71 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.091412  normal  0.96111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3430  histidine kinase  31.83 
 
 		 464 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3177  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.36 
 
 		 475 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0501501 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1409  ATPase domain-containing protein  34.71 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137041 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2064  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0576592 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1978  signal transduction protein, histidine kinase  25.64 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>