More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3870 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3870  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0110799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3488  ABC transporter related  90.44 
 
 		 251 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.841984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3796  ABC transporter related  88.45 
 
 		 251 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  50 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  50.96 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  47.23 
 
 		 293 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  41.83 
 
 		 265 aa  176  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  49.52 
 
 		 244 aa  175  7e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  42.37 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.41 
 
 		 324 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.03 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  48.19 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  44.84 
 
 		 244 aa  165  5e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  41.12 
 
 		 255 aa  166  5e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  47.44 
 
 		 269 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  47.29 
 
 		 259 aa  164  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.22 
 
 		 267 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5825  ABC transporter related  48.78 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  42.99 
 
 		 276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  43.06 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  40.4 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  45.22 
 
 		 245 aa  162  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.4 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.81 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  40 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  46.23 
 
 		 578 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  42.13 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  47.15 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  42.57 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  41.74 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  47.03 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.46 
 
 		 272 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.29 
 
 		 307 aa  159  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  45.58 
 
 		 270 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.44 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  49.08 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.82 
 
 		 337 aa  158  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.18 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  44.16 
 
 		 278 aa  158  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  42.29 
 
 		 306 aa  158  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  43.48 
 
 		 458 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.42 
 
 		 280 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0162  ABC transporter related  34.86 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  44.28 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0157  ABC transporter related  34.86 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.624067  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  42.92 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3167  ABC transporter, ATPase subunit  39.29 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  46.19 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  37.69 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  39.02 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6534  ABC transporter related  39.02 
 
 		 336 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  39.02 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  42.92 
 
 		 436 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3905  ABC transporter related  39.29 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  43.06 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  41.38 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  42.5 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0742  putative ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.267111  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 282 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  41.29 
 
 		 272 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  39.72 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2688  ABC transporter related  42.49 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.232656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  42.66 
 
 		 262 aa  156  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 438 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  40.83 
 
 		 434 aa  155  4e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  45.23 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  39.42 
 
 		 256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  44.78 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4562  ABC transporter related  43.48 
 
 		 445 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.661059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 275 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1358  ABC transporter related  40.59 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  41.36 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  42.13 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  40 
 
 		 332 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  46.5 
 
 		 259 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.71 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  40 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  47.55 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  42.79 
 
 		 286 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  37.95 
 
 		 265 aa  155  7e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  41.29 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  38.5 
 
 		 254 aa  154  9e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  45.85 
 
 		 440 aa  154  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  46.19 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  44.59 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  40.34 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  41.28 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  45.19 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  39.02 
 
 		 274 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  42.93 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.74 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>