More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0307 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  100 
 
 		 293 aa  588  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  52.58 
 
 		 265 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  55.92 
 
 		 258 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  57.94 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  43.27 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4050  ABC transporter related  46.61 
 
 		 289 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.95226  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  46.72 
 
 		 259 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1075  ABC transporter related  50.73 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.137281  normal  0.464106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3339  ABC transporter related  48.57 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00741331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  45.95 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  45.95 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  42.91 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2147  ABC transporter related  45.69 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  45.22 
 
 		 297 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0769  ABC transporter related  49.55 
 
 		 252 aa  196  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.159721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 		 273 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.29 
 
 		 264 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0713  ABC transporter related protein  47.92 
 
 		 265 aa  192  7e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.423437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  38.46 
 
 		 279 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2188  ABC transporter related  51.47 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0571708  normal  0.474002 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0671  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  47.2 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.299048  normal  0.328803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2625  ABC transporter related  42.46 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.173465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  44.84 
 
 		 264 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  42 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7199  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate/sulfonates)  44.49 
 
 		 278 aa  188  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0286852  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 		 363 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3870  ABC transporter related  45.5 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  46.51 
 
 		 288 aa  187  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.26 
 
 		 253 aa  186  3e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.78 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  41.83 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2151  ABC transporter related  44.86 
 
 		 263 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.532453 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.43 
 
 		 359 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0722  ABC transporter related  46.93 
 
 		 269 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  46.78 
 
 		 278 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0404  ABC transporter related protein  44.09 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.75 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3009  ABC transporter related  47.77 
 
 		 245 aa  185  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.87 
 
 		 261 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1421  ABC transporter related  46.15 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1210  ABC transporter related  47.89 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.502786  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  45.19 
 
 		 265 aa  185  9e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  45 
 
 		 259 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.95 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0550  ABC transporter related  42.31 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.589055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1260  ABC transporter related  46.15 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  48.17 
 
 		 384 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  44.24 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1490  nitrate transport ATP-binding subunits C and D  44.69 
 
 		 663 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.810592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1017  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  49.07 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  45.87 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0106  ABC transporter related  46.93 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0839934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0115  ABC transporter related  46.93 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0919095 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  42.57 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0096  ABC transporter related  46.93 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.25 
 
 		 353 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0239  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  42.02 
 
 		 402 aa  183  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11500  ABC transporter related  38.74 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319747  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04250  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.69 
 
 		 349 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  45.12 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  44.39 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.55 
 
 		 359 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.83 
 
 		 368 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4929  ABC transporter-like  43.05 
 
 		 278 aa  182  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  45.95 
 
 		 253 aa  182  7e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  46.04 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1573  ABC transporter related  44.44 
 
 		 269 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  46.79 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0232  taurine transporter ATP-binding subunit  44.86 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  46.52 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3458  ABC transporter related  43.04 
 
 		 260 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  44.95 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0889  ABC transporter, conserved site  40.58 
 
 		 439 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.807362  hitchhiker  0.00457345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  46.57 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1034  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9277  ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  47.32 
 
 		 271 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4202  ABC transporter related  45.16 
 
 		 286 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0113  ABC transporter related  42.13 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.692675 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7222  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.49 
 
 		 245 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2802  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.89 
 
 		 366 aa  180  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  40.81 
 
 		 280 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  41.07 
 
 		 254 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  42.19 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3159  ABC transporter-like  46.77 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  46.02 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  44.77 
 
 		 265 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08090  ABC transporter, ATP-binding component  42.92 
 
 		 269 aa  180  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.41 
 
 		 352 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1909  ABC transporter related  44.07 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  48.28 
 
 		 297 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  43.81 
 
 		 256 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1373  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 276 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.83 
 
 		 292 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  46.61 
 
 		 280 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0429  ABC transporter related  39.85 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0115377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2514  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>