More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1373 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1373  ABC transporter related protein  100 
 
 		 276 aa  539  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0106  ABC transporter related  77.08 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0839934  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0115  ABC transporter related  77.08 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0919095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0123  ABC transporter-related protein  74.7 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.897174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0096  ABC transporter related  77.08 
 
 		 259 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.241209 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0722  ABC transporter related  77.37 
 
 		 269 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3136  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 261 aa  222  4e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.257722  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.4 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1321  ABC transporter-like protein  50.39 
 
 		 288 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.251104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  46.4 
 
 		 255 aa  209  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1128  ABC transporter related  43.07 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16920  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  47.06 
 
 		 269 aa  206  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.407228  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2536  putative taurine ABC transporter, ATP-binding protein  45.42 
 
 		 264 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1764  ABC transporter related  43.8 
 
 		 263 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4936  ABC transporter related protein  48.22 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0551994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3876  ABC transporter related  42.57 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1132  ABC transporter related  42.49 
 
 		 301 aa  199  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  46.09 
 
 		 265 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  44.1 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  46.83 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1368  ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 		 278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4642  ABC transporter related  46.44 
 
 		 284 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.842575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1173  ABC transporter related  45.31 
 
 		 253 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628732  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1296  ABC transporter related  43.65 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5062  ABC transporter related  45.3 
 
 		 246 aa  195  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.024914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  39.6 
 
 		 254 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  41.6 
 
 		 254 aa  194  9e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  40.39 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  44.74 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18140  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  48.16 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4846  ABC transporter related protein  47.18 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0449477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  44.62 
 
 		 265 aa  193  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  46.77 
 
 		 270 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  48.31 
 
 		 288 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1691  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  50.63 
 
 		 280 aa  193  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0162641  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.22 
 
 		 261 aa  193  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3892  ABC transporter related  44.23 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4860  ABC transporter related  44.4 
 
 		 270 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.0856799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2011  ABC transporter related  44.26 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.284582  normal  0.208139 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.55 
 
 		 263 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3506  ABC transporter related  45.02 
 
 		 270 aa  192  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.715593  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  46.27 
 
 		 292 aa  192  7e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  47.79 
 
 		 245 aa  191  8e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0307  ABC transporter related  48.74 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  40.56 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0508  ABC transporter related  49.08 
 
 		 265 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0576814 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  42.53 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 		 253 aa  191  2e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3066  ABC transporter related protein  45.82 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.583352  normal  0.320404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3080  ABC transporter related  44.49 
 
 		 290 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.178187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4373  ABC transporter related  46.05 
 
 		 297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.403478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3808  ABC transporter-related protein  43.36 
 
 		 271 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  43.37 
 
 		 262 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 276 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  45.2 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4372  ABC transporter related  42.8 
 
 		 271 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  44.62 
 
 		 272 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4208  ABC taurine transporter, ATPase subunit  47.75 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0426  ABC transporter related  44.15 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  39.15 
 
 		 258 aa  188  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  40.47 
 
 		 253 aa  188  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  43.8 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  43.86 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  44.02 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  42.91 
 
 		 267 aa  188  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0693  ABC taurine transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000207079  normal  0.0416472 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  45.12 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  44.02 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  44.02 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  41.43 
 
 		 260 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  45.82 
 
 		 269 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  44.03 
 
 		 263 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5577  ABC transporter related  44.96 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4523  ABC transporter related  41.48 
 
 		 280 aa  186  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  43.42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1030  ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  43.86 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  42.24 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  39.09 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  43.42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  43.42 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  40.22 
 
 		 284 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2274  ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 272 aa  185  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1847  ABC transporter ATP-binding protein  42.13 
 
 		 272 aa  185  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  42.28 
 
 		 265 aa  186  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  45.05 
 
 		 271 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  48.13 
 
 		 265 aa  185  8e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1975  ABC transporter related  43.2 
 
 		 263 aa  185  9e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000056178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7481  ABC transporter ATP-binding protein  44.66 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0421656  normal  0.0607667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  43.75 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1090  taurine ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 260 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  40.82 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  46.7 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0463  ABC transporter related  46.09 
 
 		 257 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.335416  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  42.51 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>