More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3488 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3488  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  473  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.841984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3796  ABC transporter related  96.81 
 
 		 251 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3870  ABC transporter related  90.44 
 
 		 251 aa  362  3e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0110799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  49.38 
 
 		 258 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  46.19 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  51.44 
 
 		 244 aa  181  7e-45  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  50 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  41.83 
 
 		 265 aa  179  4e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  45.19 
 
 		 276 aa  174  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  42.52 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5825  ABC transporter related  49.51 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  44.05 
 
 		 298 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.78 
 
 		 308 aa  169  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.95 
 
 		 324 aa  169  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  47.29 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  46.8 
 
 		 257 aa  168  8e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  46.77 
 
 		 280 aa  168  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  48.02 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  47.25 
 
 		 244 aa  168  9e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  49.74 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.71 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  47.6 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  44.39 
 
 		 263 aa  166  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  43.98 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  45.45 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  42.48 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  45.29 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 434 aa  165  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  43.96 
 
 		 262 aa  165  5e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 		 438 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  40.47 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  42.59 
 
 		 281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  43.94 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  42.33 
 
 		 307 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  47.03 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  44.06 
 
 		 279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  46.27 
 
 		 578 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  43.56 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  45.45 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  47.74 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  42.25 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  48.33 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3524  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  42.59 
 
 		 337 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  42.66 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.88 
 
 		 306 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  46.34 
 
 		 440 aa  162  4.0000000000000004e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.78 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  44.1 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  39.6 
 
 		 262 aa  161  9e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  43.87 
 
 		 308 aa  161  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.43 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  41.07 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5010  ABC transporter related  41.6 
 
 		 263 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  41.21 
 
 		 255 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  43.44 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  41.01 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  43.44 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  44.22 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  44 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4548  ABC transporter, conserved site  44.12 
 
 		 458 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.148744  normal  0.649516 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.66 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3867  ABC transporter related  46.83 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2673  ABC transporter related  44.29 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  42.79 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  47.45 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.9 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22550  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  44.22 
 
 		 282 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.28 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.22 
 
 		 276 aa  158  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.79 
 
 		 254 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  43.17 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 264 aa  158  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  44.1 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.13 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4112  ABC transporter-related protein  40.66 
 
 		 311 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.607237  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  35.82 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0378  ABC transporter related  45.73 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.33 
 
 		 292 aa  158  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  42.53 
 
 		 262 aa  158  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5062  ABC transporter related  40.17 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.948706 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  42.25 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_003296  RS03034  ABC transporter ATP-binding protein  42.58 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.459171  normal  0.0870544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  42.57 
 
 		 286 aa  157  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  39.39 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3997  ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 		 311 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.734003  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4011  ABC transporter related  41.63 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4124  ABC transporter related  41.63 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0826  ABC transporter, ATPase subunit  43.9 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.617854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5342  ABC transporter related  39.74 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.682879 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3328  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.57 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  42.66 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5496  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.34 
 
 		 446 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  36.74 
 
 		 254 aa  158  1e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>