More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3796 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3796  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  475  1e-133  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3488  ABC transporter related  96.81 
 
 		 251 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.841984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3870  ABC transporter related  88.45 
 
 		 251 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0110799 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2833  ABC transporter related  48.56 
 
 		 258 aa  195  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0282  ABC transporter related  49.52 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.686525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0679  ABC transporter related  50.48 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0882795 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0032  ABC transporter related  43.78 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0307  ABC transporter related  45.34 
 
 		 293 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.233067 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1107  ABC transporter related  43.46 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0046  ABC transporter-related protein  48.13 
 
 		 269 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5825  ABC transporter related  48.54 
 
 		 256 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5404  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  45.93 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1899  ABC transporter-related protein  43.3 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.126966  hitchhiker  0.000000000000779353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2678  ABC transporter related  42.73 
 
 		 298 aa  165  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  41.59 
 
 		 267 aa  164  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0190  ABC transporter related  46.33 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2895  ABC transporter related  46.53 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7381  ABC transporter related  45 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.7 
 
 		 324 aa  163  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2270  ABC transporter related  46.53 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2885  ABC transporter related  46.53 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1258  ABC transporter related  46.63 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0792  ABC transporter related protein  43.28 
 
 		 308 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0408  ABC transporter related  48.7 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0896853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3306  alkanesulfonate ABC transporter, ATP binding protein  43.5 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  45.32 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  45.81 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4138  ABC transporter-like  43.06 
 
 		 255 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000371805  hitchhiker  0.00945872 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3716  ABC transporter related  44.1 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00980305 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 281 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0155  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  43.22 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588792 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6299  ABC transporter related  42.08 
 
 		 285 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1965  ABC transporter, ATP-binding protein  41.6 
 
 		 434 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2904  ABC transporter related  46.6 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0235  ABC transporter ATP-binding protein  41.6 
 
 		 438 aa  160  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0408  ABC transporter related  42.51 
 
 		 262 aa  159  4e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.468128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0420  ABC transporter related  45.54 
 
 		 265 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.889733 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  44 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0079  ABC transporter related  41.86 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6226  ABC taurine transporter, ATPase subunit  46.23 
 
 		 265 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3642  ABC transporter related  41.2 
 
 		 239 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000649736  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1183  ABC transporter related  43.56 
 
 		 279 aa  158  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0458641  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0880  ABC transporter related  40.98 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0392492  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0968  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 276 aa  159  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.315946 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  43.43 
 
 		 276 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5225  ABC transporter related  43.28 
 
 		 304 aa  158  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2057  ABC transporter related  44.78 
 
 		 280 aa  158  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3407  ABC transporter related  44.1 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.81445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1940  ABC transporter ATP binding protein  42.86 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000682948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0571  ABC transporter related  46.05 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.750725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2221  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000225021  normal  0.260255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1471  ABC transporter related  42.79 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1077  ATPase  41.31 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.096527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  39.9 
 
 		 254 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0054  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  39.53 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2171  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 		 276 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6048  ABC transporter related  43.5 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.713083 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  37.79 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6427  ABC transporter related  44.95 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5555  ABC transporter related  44.95 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356356  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3757  ABC transporter related  43.27 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3083  ABC transporter related  43.37 
 
 		 306 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.724622  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1394  ABC transporter-like protein  35.96 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317135  normal  0.304507 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3034  ABC transporter related  44.33 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.652183  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5920  ABC transporter related  44.95 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4096  ABC transporter related protein  44.5 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0795194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1243  ABC transporter related  43 
 
 		 332 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.756326  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6589  ABC transporter related  43 
 
 		 332 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3451  ABC transporter related  44.78 
 
 		 578 aa  156  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.90461  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2032  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 278 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545807  normal  0.262342 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  43.2 
 
 		 282 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6193  ABC transporter related  43 
 
 		 332 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  39.39 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  37.21 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2526  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1733  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2571  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4537  ABC transporter related  44.74 
 
 		 436 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.989586 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3465  ABC transporter related  44.74 
 
 		 436 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.320704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2563  ABC transporter related  45.45 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3325  ABC transporter related protein  45.54 
 
 		 440 aa  155  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  42.13 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1387  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  42.79 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.195746  normal  0.160104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  42.51 
 
 		 261 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0546  ABC transporter related  42.29 
 
 		 245 aa  155  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3600  ABC transporter related  43.67 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00199632  normal  0.177255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0482  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 255 aa  155  7e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3269  ABC transporter related  43.35 
 
 		 263 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874896 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4285  ABC transporter related  42.08 
 
 		 262 aa  155  8e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0982673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0331  ABC transporter related  46.43 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4675  nitrate ABC transporter, ATPase subunits C and D  41.92 
 
 		 280 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3960  ABC transporter related  42.08 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6201  ABC transporter related  39.02 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.102037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5606  ABC transporter related protein  41.24 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.231398  normal  0.622338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  41.58 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34780  putative ABC transporter ATP-binding component  43.22 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0748092  normal  0.0155255 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4264  ABC transporter related  44.88 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0906906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  38.91 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>