More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3105 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3105  putative outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 435 aa  873    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22621 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0746  Outer membrane protein (porin)-like  51.06 
 
 		 415 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.304817  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3412  outer membrane protein (porin)-like protein  53.65 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000420831 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0647  outer membrane protein (porin)-like protein  48.61 
 
 		 431 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602825  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.38 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.38 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  28.99 
 
 		 376 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  27.71 
 
 		 355 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.41 
 
 		 355 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  29.82 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  29.95 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  26.67 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  27.89 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  27.89 
 
 		 376 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  27.95 
 
 		 401 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  26.85 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  28.82 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  27.63 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  28.82 
 
 		 392 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  30.59 
 
 		 369 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  29.03 
 
 		 403 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  27.52 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  29.09 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.12 
 
 		 389 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  28.37 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  27.23 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  29.22 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.72 
 
 		 381 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  29.85 
 
 		 386 aa  100  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  27.37 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  28.38 
 
 		 368 aa  100  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31.52 
 
 		 436 aa  99.8  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31.52 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31.52 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31.52 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  29.85 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.43 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31.52 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31.52 
 
 		 386 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  30.29 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.72 
 
 		 381 aa  99  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  29.17 
 
 		 387 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  31.13 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  32.71 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  30.29 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.21 
 
 		 357 aa  97.1  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  31.13 
 
 		 386 aa  96.7  8e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  26.64 
 
 		 335 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  29.23 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  29.23 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  27.71 
 
 		 349 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  29.23 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  25.81 
 
 		 368 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  33.33 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  29.23 
 
 		 379 aa  96.3  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  29.45 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  29.45 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  28.35 
 
 		 379 aa  95.5  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  32.02 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  25.85 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  29.01 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  29.55 
 
 		 382 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  28.34 
 
 		 367 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  29.73 
 
 		 379 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  28.47 
 
 		 353 aa  93.6  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  29.73 
 
 		 379 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  32.37 
 
 		 379 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  28.79 
 
 		 389 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  32.45 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  26.82 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  27.53 
 
 		 383 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  27.53 
 
 		 383 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  28.46 
 
 		 395 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  28.46 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  28.53 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  26.6 
 
 		 359 aa  90.5  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  31.09 
 
 		 387 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  28.06 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  29.96 
 
 		 383 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  30 
 
 		 397 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  32.32 
 
 		 383 aa  90.5  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  31.91 
 
 		 354 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.96 
 
 		 385 aa  90.1  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  31.91 
 
 		 354 aa  90.1  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  27.53 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  29.18 
 
 		 383 aa  89.7  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  29.3 
 
 		 374 aa  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  32.32 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  26.3 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  28.25 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  27.01 
 
 		 383 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  32.32 
 
 		 394 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.96 
 
 		 385 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  28.75 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  32.32 
 
 		 394 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  29.34 
 
 		 357 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  29.73 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  32.32 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  28.93 
 
 		 382 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  28.71 
 
 		 388 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>