More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0746 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0746  Outer membrane protein (porin)-like  100 
 
 		 415 aa  825    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.304817  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0647  outer membrane protein (porin)-like protein  69.84 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0602825  normal  0.3868 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3412  outer membrane protein (porin)-like protein  53.9 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000420831 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3105  putative outer membrane protein (porin)  51.06 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  29.55 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  29.29 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  28.67 
 
 		 403 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  32.84 
 
 		 409 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  27.95 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  28.74 
 
 		 368 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.23 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.23 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  28.91 
 
 		 383 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.02 
 
 		 371 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.33 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  28.24 
 
 		 377 aa  104  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.09 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  29.76 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  29.34 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  30.85 
 
 		 348 aa  99.8  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  26.65 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  28.25 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.14 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  28.89 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  28.02 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  30.51 
 
 		 348 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  27.73 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  30.98 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  27.73 
 
 		 354 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  30.6 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  30.6 
 
 		 383 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  27.57 
 
 		 355 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  29.46 
 
 		 383 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  26.42 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  29.27 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  29.27 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  29.46 
 
 		 383 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  29.4 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  28.29 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  28.29 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  28.29 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  28.29 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  26.88 
 
 		 376 aa  96.7  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  28.29 
 
 		 379 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  29.23 
 
 		 430 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  27.75 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  27.75 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  29.23 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  28.71 
 
 		 383 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  27.15 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  25.41 
 
 		 386 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  27.83 
 
 		 373 aa  95.5  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  28.67 
 
 		 357 aa  94.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  29.01 
 
 		 390 aa  94.4  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  28.82 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  29.25 
 
 		 383 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  28.97 
 
 		 362 aa  94  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  28.47 
 
 		 402 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  28.95 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.01 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  28.95 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  28.95 
 
 		 430 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0215  outer membrane porin OpcP  27.34 
 
 		 382 aa  94  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  27.03 
 
 		 388 aa  94  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  29.85 
 
 		 351 aa  93.6  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3533  OmpC family outer membrane porin  32.1 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154111  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  28.71 
 
 		 390 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  28.71 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  28.71 
 
 		 383 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  34.17 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  28.2 
 
 		 383 aa  92.8  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  26.13 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  27.14 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  26.13 
 
 		 392 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  27.6 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  31.56 
 
 		 379 aa  92  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  27.59 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  28.98 
 
 		 395 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0926  OmpC family outer membrane porin  34.25 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412323  normal  0.203503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  27.05 
 
 		 376 aa  91.3  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  30.04 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  27 
 
 		 363 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  34.17 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  28.97 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  29.63 
 
 		 384 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1057  OmpC family outer membrane porin  27.87 
 
 		 408 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.117495  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  30.95 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  30.95 
 
 		 436 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  30.95 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  30.95 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  30.95 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  30.95 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  26.09 
 
 		 335 aa  90.5  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  29.12 
 
 		 386 aa  90.5  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  32.8 
 
 		 366 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6875  porin  29.79 
 
 		 408 aa  90.5  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00204138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3855  porin  27.59 
 
 		 388 aa  90.1  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5937  porin  27.25 
 
 		 353 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.022245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  30.56 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  27.59 
 
 		 386 aa  90.1  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>