153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1623 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 392 aa  790    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  34.23 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  34.36 
 
 		 411 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  34.29 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  33.62 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  33.66 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  31.22 
 
 		 426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29.46 
 
 		 426 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  31.82 
 
 		 292 aa  153  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.38 
 
 		 395 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  33.81 
 
 		 285 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  29.73 
 
 		 390 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.94 
 
 		 392 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  29.58 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  31.21 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  29.79 
 
 		 411 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  29.49 
 
 		 288 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  30.29 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  30.65 
 
 		 282 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.85 
 
 		 454 aa  110  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  30.04 
 
 		 280 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  29.89 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  28.5 
 
 		 244 aa  106  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  29.69 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  28.05 
 
 		 284 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  27.64 
 
 		 312 aa  96.3  8e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  26.72 
 
 		 553 aa  94  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  28.81 
 
 		 262 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  27.57 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  26.59 
 
 		 315 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  30.52 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  25.44 
 
 		 309 aa  84.7  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  25.91 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  30.4 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  25.81 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  26.4 
 
 		 294 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  27.33 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  28.63 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  29.3 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  26.79 
 
 		 293 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  30.77 
 
 		 462 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  31.03 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  26.04 
 
 		 294 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  28.44 
 
 		 278 aa  64.7  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  27.8 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  27.1 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  25.47 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  26.94 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  28.16 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  25.66 
 
 		 295 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  24.9 
 
 		 359 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2913  2-alkenal reductase  40 
 
 		 393 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0108818  normal  0.221837 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0534  2-alkenal reductase  42.03 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  33.33 
 
 		 463 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3234  2-alkenal reductase  32.67 
 
 		 575 aa  53.9  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.222667  normal  0.0363808 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  35.05 
 
 		 511 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1212  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.91 
 
 		 471 aa  53.5  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3622  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.83 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0344622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  23.08 
 
 		 285 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  23.35 
 
 		 342 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  39.13 
 
 		 361 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  38.24 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  24.52 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1353  trypsin-like serine protease  30.53 
 
 		 673 aa  51.2  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0590  2-alkenal reductase  38.81 
 
 		 453 aa  50.4  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000722472  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  29.1 
 
 		 1103 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  33.01 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0919  2-alkenal reductase  31.18 
 
 		 377 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000486689  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  29.28 
 
 		 459 aa  49.7  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  25.11 
 
 		 286 aa  49.7  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0459  2-alkenal reductase  32.32 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  43.08 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2990  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.07 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0069  trypsin-like serine protease  36.99 
 
 		 419 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0357916  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21640  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  31.76 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00345268  normal  0.0571371 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  20.32 
 
 		 282 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  26.67 
 
 		 283 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  26.92 
 
 		 455 aa  47.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1344  trypsin  31.82 
 
 		 594 aa  47.4  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0379667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.38 
 
 		 523 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  33.77 
 
 		 394 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1405  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.34 
 
 		 345 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  35.82 
 
 		 454 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1654  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  38.81 
 
 		 329 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  31.34 
 
 		 409 aa  46.6  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.07 
 
 		 545 aa  46.6  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1181  serine endoprotease  28.02 
 
 		 487 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  27.47 
 
 		 474 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1435  peptidase S1C, Do  32.84 
 
 		 545 aa  46.2  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.600827 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  31.51 
 
 		 469 aa  46.2  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  27.47 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  34.67 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  34.21 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  26.37 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  27.47 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  27.47 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  27.47 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00159  hypothetical protein  27.47 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  27.47 
 
 		 474 aa  46.2  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0703  2-alkenal reductase  38.18 
 
 		 425 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>