59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6096 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 297 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  46.6 
 
 		 285 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  45.08 
 
 		 286 aa  262  6e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  35.16 
 
 		 310 aa  130  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  29.68 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  32.82 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  28.27 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  31.09 
 
 		 291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  29.43 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  28.86 
 
 		 312 aa  112  9e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  27.82 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  31.97 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  31.34 
 
 		 282 aa  94.4  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  30.14 
 
 		 282 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  28.63 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  27.82 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  33.78 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  35.14 
 
 		 284 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  30.2 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  29 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29 
 
 		 426 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  31.28 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  26.84 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  28.73 
 
 		 292 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  26.36 
 
 		 411 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  26.91 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  27.72 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  27.95 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  26.98 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  24.3 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  24.07 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  30.57 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  26.47 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  27.57 
 
 		 345 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  27.2 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  26.94 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  26.4 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  27.63 
 
 		 342 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  27.43 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  32.06 
 
 		 561 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  27.59 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  31.48 
 
 		 411 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  26.43 
 
 		 386 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  27.91 
 
 		 390 aa  50.1  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  24.89 
 
 		 392 aa  49.7  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  26.99 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  26.84 
 
 		 275 aa  49.7  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  31.06 
 
 		 293 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  26.9 
 
 		 462 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  25 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  26.09 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  28.45 
 
 		 553 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  31.48 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  25.23 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.94 
 
 		 454 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  26.61 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  25.57 
 
 		 294 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  25.71 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>