56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002904 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  100 
 
 
315 aa  662    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  75.87 
 
 
315 aa  520  1e-146  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  63.14 
 
 
325 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  62.67 
 
 
312 aa  407  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  52.1 
 
 
309 aa  348  5e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  38.79 
 
 
345 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  37.93 
 
 
310 aa  198  7.999999999999999e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  34.96 
 
 
291 aa  138  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  29.68 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  30.54 
 
 
285 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  33.94 
 
 
258 aa  121  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  33.02 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  30.15 
 
 
426 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  31.23 
 
 
426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  27.9 
 
 
286 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  30.12 
 
 
390 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  28.63 
 
 
282 aa  103  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  32.53 
 
 
280 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  27.93 
 
 
386 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  28.27 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  27.54 
 
 
282 aa  95.5  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  29.57 
 
 
376 aa  92.8  7e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  27.57 
 
 
392 aa  91.3  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  26.03 
 
 
400 aa  90.1  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  26.76 
 
 
282 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  24.82 
 
 
392 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  26.7 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  26.76 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  24.88 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  27.04 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  23.88 
 
 
288 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  26.39 
 
 
411 aa  74.3  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  23.26 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  25.36 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  26.44 
 
 
436 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  28.44 
 
 
462 aa  65.9  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.77 
 
 
395 aa  65.5  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  24.91 
 
 
454 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  30.94 
 
 
561 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  22 
 
 
553 aa  61.2  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  31.25 
 
 
400 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  27.6 
 
 
342 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  25.97 
 
 
293 aa  55.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  26.51 
 
 
345 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  25.28 
 
 
278 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  23.93 
 
 
282 aa  52.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.18 
 
 
368 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  23.87 
 
 
359 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  23.1 
 
 
283 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  24.79 
 
 
322 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  25.18 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  25.44 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  28.3 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  24.12 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  25.99 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  23.68 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>