55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2799 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 291 aa  578  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  40.24 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  34.96 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  34.31 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 312 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  33.91 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  33.09 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  30.89 
 
 		 309 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  31.09 
 
 		 297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  38.22 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  31.91 
 
 		 285 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  31.8 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  31.15 
 
 		 292 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  30.08 
 
 		 392 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  34.3 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  31.15 
 
 		 262 aa  100  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  35 
 
 		 436 aa  99.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  33.6 
 
 		 386 aa  99.4  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  32.61 
 
 		 426 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  28.81 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  29.96 
 
 		 400 aa  95.5  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  30.3 
 
 		 282 aa  95.5  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  29.43 
 
 		 282 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  32.42 
 
 		 376 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  29 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  30.28 
 
 		 390 aa  90.5  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  27.94 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  29 
 
 		 282 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  25 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  31.71 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  28 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  28 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  28.63 
 
 		 392 aa  72  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  35.67 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  30.91 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  33.7 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  31.62 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  35.66 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.62 
 
 		 395 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  24.64 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  24.89 
 
 		 553 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  33.58 
 
 		 561 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.02 
 
 		 454 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  21.58 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  22.67 
 
 		 282 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.25 
 
 		 368 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  27.73 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  27.48 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  29.44 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  29.96 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  37.5 
 
 		 283 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  29.96 
 
 		 294 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  29.34 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>