76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2732 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  793    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  31.31 
 
 		 400 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  30.39 
 
 		 426 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  32.94 
 
 		 292 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  32.09 
 
 		 386 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  28.35 
 
 		 426 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  29.73 
 
 		 392 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  30.77 
 
 		 436 aa  136  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.21 
 
 		 411 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  26.72 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  27.65 
 
 		 376 aa  123  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  32.16 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  33.46 
 
 		 282 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  30.51 
 
 		 282 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.21 
 
 		 395 aa  114  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  30.24 
 
 		 315 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  110  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  30.12 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  24.57 
 
 		 411 aa  107  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 312 aa  106  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  29.43 
 
 		 325 aa  103  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  35.12 
 
 		 462 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  29.25 
 
 		 285 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  31.2 
 
 		 269 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  28.93 
 
 		 282 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.55 
 
 		 454 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  30.92 
 
 		 280 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  33.1 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  27.84 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  29.18 
 
 		 282 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  29.78 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  30.2 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  31.97 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  25.86 
 
 		 553 aa  82.8  0.000000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  26.64 
 
 		 345 aa  79.7  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  24.69 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  23.4 
 
 		 284 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  25 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  27.33 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  26.92 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  27.31 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  28.57 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  25.86 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  21.86 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  25.86 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  26.33 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  24.05 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  28.42 
 
 		 286 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  28.19 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  28.38 
 
 		 283 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  27.59 
 
 		 295 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  23.49 
 
 		 266 aa  51.2  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1348  hypothetical protein  31.9 
 
 		 552 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  30.5 
 
 		 285 aa  50.1  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  27.91 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  28 
 
 		 322 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  24.24 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  36.52 
 
 		 504 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  28.29 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  30.1 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  35.09 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  22.64 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  26.51 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  26.28 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  32.95 
 
 		 478 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  41.89 
 
 		 509 aa  46.6  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  24.29 
 
 		 314 aa  46.2  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2221  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  39.71 
 
 		 112 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  24.18 
 
 		 284 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1096  2-alkenal reductase  40.3 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000450263  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1068  serine protease, DegP/HtrA family  37.5 
 
 		 394 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000137948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.67 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  23.63 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1285  serine protease  37.5 
 
 		 394 aa  43.1  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000207933  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  22.83 
 
 		 278 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  34.74 
 
 		 503 aa  42.7  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>