75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2981 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  100 
 
 
359 aa  699    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  90.12 
 
 
342 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  91.98 
 
 
345 aa  551  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  50.62 
 
 
368 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  39.72 
 
 
322 aa  162  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  43.73 
 
 
275 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  35.03 
 
 
294 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  35.03 
 
 
294 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  35.03 
 
 
294 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  41.35 
 
 
275 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  38.4 
 
 
250 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  41.35 
 
 
275 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  38.25 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  32.42 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  34.34 
 
 
278 aa  113  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62270  hypothetical protein  33.44 
 
 
295 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118549  normal  0.331966 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  33.33 
 
 
294 aa  107  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  32.42 
 
 
295 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  36.26 
 
 
287 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1999  hypothetical protein  32.97 
 
 
302 aa  99.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000468995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  32.34 
 
 
308 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  32.04 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  30.68 
 
 
392 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  35.48 
 
 
274 aa  93.6  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0298  hypothetical protein  28.91 
 
 
293 aa  92  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1104  hypothetical protein  32.86 
 
 
291 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0441  hypothetical protein  29.48 
 
 
293 aa  89.4  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.946293 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  40.14 
 
 
454 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  35.53 
 
 
462 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  32.7 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0430  hypothetical protein  34.07 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  40.83 
 
 
561 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  27.73 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0421  protein of unknown function DUF399  33.33 
 
 
305 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.950596  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  29.48 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  24.57 
 
 
283 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  25.65 
 
 
282 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  28.76 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  36.8 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  25.37 
 
 
282 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  25.62 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  33.04 
 
 
411 aa  70.5  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  29.02 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  25.86 
 
 
390 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  27.95 
 
 
297 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0707  hypothetical protein  29.12 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  30.67 
 
 
386 aa  65.1  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.57 
 
 
411 aa  64.7  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  25.82 
 
 
400 aa  63.9  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  24.51 
 
 
262 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2390  protein of unknown function DUF399  29.8 
 
 
266 aa  62.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.898186  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  27 
 
 
426 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  25.13 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  27.82 
 
 
288 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  26 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  25.52 
 
 
269 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  24.91 
 
 
284 aa  57.4  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  24.89 
 
 
292 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  25.45 
 
 
392 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  29.52 
 
 
436 aa  54.7  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  25.93 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  24.61 
 
 
285 aa  53.5  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  26.05 
 
 
310 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  28.21 
 
 
553 aa  53.1  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  20.18 
 
 
244 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  23.87 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  23.79 
 
 
312 aa  50.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  27.05 
 
 
286 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  24.17 
 
 
309 aa  48.5  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  27.52 
 
 
395 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  22.88 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  29.15 
 
 
291 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  25.6 
 
 
285 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  23.08 
 
 
345 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>