51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1026 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  100 
 
 		 286 aa  591  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  61.75 
 
 		 285 aa  389  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  45.08 
 
 		 297 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  29.3 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  27.9 
 
 		 315 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  27.61 
 
 		 325 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  29.66 
 
 		 315 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  34.86 
 
 		 258 aa  106  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  31.8 
 
 		 291 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  29.96 
 
 		 310 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  28.81 
 
 		 312 aa  96.7  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  90.1  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  25.28 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  28.57 
 
 		 282 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  29.21 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  29.66 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  30.08 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  27.03 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  33.88 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  25.36 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  30.93 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  33.09 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  24.58 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  30.83 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  29.59 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  29.08 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  29.73 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  24.25 
 
 		 392 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  27.08 
 
 		 411 aa  58.9  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  28.42 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  29.45 
 
 		 411 aa  52.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  34.4 
 
 		 280 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  27.27 
 
 		 400 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  25.11 
 
 		 392 aa  49.7  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  27.75 
 
 		 359 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  25.29 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  28.67 
 
 		 561 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  25.78 
 
 		 294 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2977  hypothetical protein  25.12 
 
 		 250 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  25.66 
 
 		 386 aa  46.2  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  26.79 
 
 		 345 aa  46.2  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  28.5 
 
 		 342 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0457  hypothetical protein  24.69 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.252965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1052  chain X  22 
 
 		 282 aa  45.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  26.42 
 
 		 274 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  22.96 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  21.72 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  22.09 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0170  TonB-dependent colicin lipoprotein, putative  22.55 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  28.7 
 
 		 395 aa  42.7  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>