65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1775 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1775  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  603  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.331054  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3139  hypothetical protein  45.79 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0349  hypothetical protein  44.89 
 
 		 282 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000148498 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1114  hypothetical protein  41.25 
 
 		 285 aa  221  9e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0548  protein of unknown function DUF399  40.21 
 
 		 282 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.79129 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0534  protein of unknown function DUF399  39.08 
 
 		 282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1023  hypothetical protein  40.83 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2488  protein of unknown function DUF399  36.02 
 
 		 284 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1760  protein of unknown function DUF399  35.16 
 
 		 262 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0505659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1815  protein of unknown function DUF399  34.62 
 
 		 280 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0316353 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2756  protein of unknown function DUF399  34.27 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.990555 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1357  hypothetical protein  31.91 
 
 		 400 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690238  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2382  PDZ/DHR/GLGF  33.05 
 
 		 436 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1623  hypothetical protein  29.49 
 
 		 392 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3354  protein of unknown function DUF399  30.58 
 
 		 426 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.331777 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0907  protein of unknown function DUF399  28.95 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0724996  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.51 
 
 		 411 aa  105  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0117  hypothetical protein  27.24 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1083  protein of unknown function DUF399  29.88 
 
 		 386 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1353  protein of unknown function DUF399  27.45 
 
 		 244 aa  96.7  4e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000200413  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2732  hypothetical protein  27.84 
 
 		 390 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.196703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0461  protein of unknown function DUF399  29.9 
 
 		 392 aa  87.8  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.978142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03054  hypothetical protein  26.09 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2937  hypothetical protein  23.66 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302758 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002904  uncharacterized iron-regulated protein  23.88 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1026  protein of unknown function DUF399  33.88 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.604469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2799  protein of unknown function DUF399  28 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4646  protein of unknown function DUF399  28.97 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.342836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3472  hypothetical protein  24.2 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1409  hypothetical protein  28.02 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00776677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1590  hypothetical protein  22.86 
 
 		 325 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0011  hypothetical protein  23.81 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.113943  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0135  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.54 
 
 		 454 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0450111 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0541  PDZ/DHR/GLGF  32.41 
 
 		 462 aa  65.9  0.0000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0149292  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43594  predicted protein  23.53 
 
 		 553 aa  64.3  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4550  hypothetical protein  30.71 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000869359  decreased coverage  0.0000000103556 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1736  hypothetical protein  23.67 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.317889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6096  protein of unknown function DUF399  24.3 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.939733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3071  protein of unknown function DUF399  30.08 
 
 		 342 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4686  hypothetical protein  29.92 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433823  hitchhiker  0.00020282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4684  hypothetical protein  25.38 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139338  unclonable  2.48633e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1587  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  26.11 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.397404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2981  hypothetical protein  22.49 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.485349  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0868  putative lipoprotein  21.5 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.295521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3179  protein of unknown function DUF399  23.36 
 
 		 345 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0322303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4787  protein of unknown function DUF399  24.87 
 
 		 256 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3346  protein of unknown function DUF399  22.41 
 
 		 411 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0748  hypothetical protein  24.77 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000000345483  decreased coverage  0.00000000000109696 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2447  protein of unknown function DUF399  27.71 
 
 		 561 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0996  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000003663  unclonable  1.3879200000000002e-18 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0610  hypothetical protein  23.38 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0483  hypothetical protein  24.29 
 
 		 275 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4797  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000115582  unclonable  0.0000208152 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0118  CjrA  24.51 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3428  putative lipoprotein  22.87 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243183  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5421  hypothetical protein  23.58 
 
 		 293 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00114595  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1026  hypothetical protein  23.94 
 
 		 258 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.823473  normal  0.048424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0511  protein of unknown function DUF399  25.24 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3469  hypothetical protein  23.48 
 
 		 284 aa  47  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1348  hypothetical protein  24.18 
 
 		 552 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3583  hypothetical protein  21.72 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2253  hypothetical protein  23.53 
 
 		 275 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.558397  normal  0.565057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0652  hypothetical protein  20 
 
 		 274 aa  43.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0600  hypothetical protein  23.01 
 
 		 275 aa  42.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.294866  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42580  iron(III) ABC transporter  23.2 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000751196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>